More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2945 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  100 
 
 
381 aa  768    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  36.91 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  35.87 
 
 
391 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  33.16 
 
 
379 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  35.97 
 
 
379 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  32.02 
 
 
384 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  31.82 
 
 
379 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  26.26 
 
 
376 aa  139  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  29.73 
 
 
378 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  31.48 
 
 
377 aa  132  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  30.21 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  32.13 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  32.04 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  30.13 
 
 
387 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  32.72 
 
 
381 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  28.04 
 
 
368 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  31.73 
 
 
377 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  32 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  27.46 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0304  aminotransferase class V  27.46 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  30.09 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  27.46 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  26.8 
 
 
387 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  25.15 
 
 
357 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  25.68 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  29.45 
 
 
377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02180  Kynureninase  29.38 
 
 
425 aa  113  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.641919  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  27.16 
 
 
373 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  29.11 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  28.76 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  28.44 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  31.82 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  27.81 
 
 
409 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0295  aminotransferase, class V  27.46 
 
 
373 aa  109  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1353  kynureninase  32.2 
 
 
423 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6512  kynureninase  30.33 
 
 
397 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4630  kynureninase  30.98 
 
 
421 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0472348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3724  aminotransferase, class V  26.69 
 
 
374 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  31.27 
 
 
372 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  24.73 
 
 
373 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1437  aminotransferase class V  29 
 
 
422 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000186875 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0295  aminotransferase, class V  26.39 
 
 
374 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1542  kynureninase  34.55 
 
 
423 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0917927  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2085  kynureninase  25.9 
 
 
395 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867817  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2100  kynureninase  30.86 
 
 
422 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  28.79 
 
 
416 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  33.33 
 
 
355 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3452  aminotransferase, class V  23.6 
 
 
381 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.237823  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4796  aminotransferase class V  29.04 
 
 
362 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.688685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1432  kynureninase  28.46 
 
 
426 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0731734  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  30.74 
 
 
380 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1230  kynureninase  28.74 
 
 
393 aa  99.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0974944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4413  kynureninase  25.37 
 
 
378 aa  99.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  25.61 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  26.12 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3396  kynureninase  30.92 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337289  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1534  kynureninase  28.46 
 
 
393 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.213107  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3556  aminotransferase, class V  27.35 
 
 
370 aa  96.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1799  aminotransferase, class V  30.19 
 
 
347 aa  95.9  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365692  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  26.98 
 
 
427 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  29.77 
 
 
345 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3396  kynureninase  27.79 
 
 
413 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  25.73 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  31.47 
 
 
381 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0679  kynureninase  31.56 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  27.95 
 
 
413 aa  93.2  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  29.08 
 
 
389 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  26.05 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  25 
 
 
416 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1865  aminotransferase class V  32.57 
 
 
433 aa  93.2  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  29.38 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  26.85 
 
 
394 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  28.35 
 
 
896 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9107  kynureninase  28.06 
 
 
407 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2025  aminotransferase class V  31.33 
 
 
418 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  27.78 
 
 
374 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.57 
 
 
394 aa  90.1  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  28.33 
 
 
341 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3208  kynureninase  28.52 
 
 
416 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.85 
 
 
372 aa  89.7  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4022  aminotransferase class V  24.4 
 
 
372 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2650  kynureninase  28.3 
 
 
418 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0808  kynureninase  28.48 
 
 
418 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0265  kynureninase  28.64 
 
 
373 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3228  kynureninase  25.35 
 
 
416 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  28.98 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  26.81 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2385  aminotransferase class V  28.53 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00212379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  32.11 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37610  kynureninase  28.17 
 
 
416 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88589  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.09 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0734  kynureninase  26.43 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4740  aminotransferase, class V  33.15 
 
 
492 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00758  kynureninase  26.92 
 
 
423 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0563676  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3426  aminotransferase, class V  33.15 
 
 
492 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.19 
 
 
406 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1885  kynureninase  28.4 
 
 
427 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0242  kynureninase  28.7 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  32.61 
 
 
492 aa  86.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6950  kynureninase  27.35 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>