More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2935 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  100 
 
 
383 aa  779    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  60.53 
 
 
380 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  59.16 
 
 
379 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  58.49 
 
 
379 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  58.22 
 
 
379 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  57.96 
 
 
379 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  60.16 
 
 
379 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  56.99 
 
 
380 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  43.91 
 
 
389 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  46.42 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  45.12 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  46.42 
 
 
402 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  45.14 
 
 
390 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  43.54 
 
 
383 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  46.03 
 
 
403 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  46.3 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  42.97 
 
 
383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  41.56 
 
 
390 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  44.62 
 
 
383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  41.88 
 
 
385 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  41.25 
 
 
384 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  46.05 
 
 
382 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  40 
 
 
383 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  41.53 
 
 
385 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.36 
 
 
382 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  40 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  40.73 
 
 
390 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  42.02 
 
 
381 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
382 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  42.37 
 
 
382 aa  246  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  40.77 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  41.88 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  43.75 
 
 
384 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  41.84 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  43.22 
 
 
385 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  42.53 
 
 
391 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
388 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  41.64 
 
 
391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  40.78 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  41.25 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  41.16 
 
 
384 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  43.42 
 
 
382 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  42.71 
 
 
387 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  41.27 
 
 
390 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  39.89 
 
 
395 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  42.63 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  35.9 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  35.37 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  36.13 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  35.47 
 
 
386 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.66 
 
 
394 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  33.42 
 
 
388 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  35.88 
 
 
390 aa  170  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.76 
 
 
387 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.06 
 
 
394 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  33.16 
 
 
381 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  34.62 
 
 
390 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.32 
 
 
388 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  33.25 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.43 
 
 
389 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  33.88 
 
 
391 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  36 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.61 
 
 
394 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.16 
 
 
385 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  33.69 
 
 
383 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  35.73 
 
 
385 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  32.81 
 
 
385 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  37.43 
 
 
388 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  37.43 
 
 
388 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  34.9 
 
 
389 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  37.43 
 
 
388 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  33.33 
 
 
388 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.38 
 
 
378 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  30.73 
 
 
403 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  35.2 
 
 
385 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  36.76 
 
 
390 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.68 
 
 
389 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  34.79 
 
 
378 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  32.7 
 
 
381 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  31.11 
 
 
406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  34.58 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  34.58 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  34.9 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  32.31 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  34.26 
 
 
396 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  32.35 
 
 
402 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  34.78 
 
 
396 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.06 
 
 
390 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.98 
 
 
397 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  32.09 
 
 
402 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  32.09 
 
 
402 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1833  putative thiolase  31.23 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0913085  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  33.78 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  30.65 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  29.47 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  33.33 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  31.39 
 
 
388 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  33.59 
 
 
393 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.26 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>