48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2854 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2854  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.333627  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0045  hypothetical protein  49.33 
 
 
303 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3925  hypothetical protein  41.03 
 
 
227 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.750282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2231  hypothetical protein  39.32 
 
 
233 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3168  hypothetical protein  40.2 
 
 
224 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0887  hypothetical protein  37.98 
 
 
232 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106843  hitchhiker  0.000000000926044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1160  hypothetical protein  31.95 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2371  hypothetical protein  42.31 
 
 
191 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340146  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1513  conserved hypothetical protein-like protein  38.36 
 
 
212 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0715  hypothetical protein  37.7 
 
 
223 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2660  hypothetical protein  41.45 
 
 
192 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2705  hypothetical protein  41.45 
 
 
192 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.953321  normal  0.0204649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2690  hypothetical protein  41.45 
 
 
192 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4476  hypothetical protein  30.58 
 
 
247 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1349  hypothetical protein  36.71 
 
 
266 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  0.0687913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2178  hypothetical protein  49.04 
 
 
180 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.570864  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5914  hypothetical protein  34.78 
 
 
196 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1093  hypothetical protein  35.9 
 
 
205 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10371  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.809389  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0887  hypothetical protein  36.84 
 
 
204 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2141  hypothetical protein  33.54 
 
 
180 aa  89.7  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000110374  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2460  hypothetical protein  34.68 
 
 
200 aa  89.7  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7291  hypothetical protein  33.96 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000516756  hitchhiker  0.000182855 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0591  hypothetical protein  32.32 
 
 
172 aa  87  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.59111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5198  hypothetical protein  36.94 
 
 
211 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2321  hypothetical protein  28.07 
 
 
240 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0500  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2786  hypothetical protein  36.25 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1667  hypothetical protein  29.55 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0837256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4483  hypothetical protein  29.94 
 
 
194 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0746  hypothetical protein  30.25 
 
 
172 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4728  hypothetical protein  34.63 
 
 
208 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.114541  normal  0.213547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2437  hypothetical protein  29.59 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254046  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3640  hypothetical protein  28.33 
 
 
207 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.00000000000227371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0023  hypothetical protein  30.77 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2641  hypothetical protein  28.22 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1547  hypothetical protein  32.61 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5582  hypothetical protein  33.53 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0785  hypothetical protein  29.63 
 
 
175 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3453  hypothetical protein  31.41 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.948893  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2900  hypothetical protein  27.69 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4943  hypothetical protein  32.22 
 
 
245 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00429148  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00685  hypothetical protein  29.49 
 
 
207 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0834282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0108  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  unclonable  1.3521599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2513  hypothetical protein  29.3 
 
 
209 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.376167  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4157  hypothetical protein  42.11 
 
 
104 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4158  signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
98 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2180  hypothetical protein  31.19 
 
 
208 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>