14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2844 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2844  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  691  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  1.26793e-05  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1303  hypothetical protein  50.65 
 
 
322 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.240695  hitchhiker  7.78686e-10 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0953  hypothetical protein  43.4 
 
 
305 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0846  hypothetical protein  32.67 
 
 
328 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.22305  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3205  hypothetical protein  32.97 
 
 
296 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42811  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0300  hypothetical protein  33.45 
 
 
295 aa  152  6e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2177  Domain of unknown function DUF1814  30.86 
 
 
288 aa  81.3  2e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  2.11086e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4191  hypothetical protein  25.96 
 
 
284 aa  65.5  1e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0915772  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0812  hypothetical protein  27.68 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.113076  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3355  hypothetical protein  24.88 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1224  hypothetical protein  25.81 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0961  hypothetical protein  42.19 
 
 
109 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000301997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1368  hypothetical protein  34.95 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1610  hypothetical protein  51.11 
 
 
234 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>