More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2805 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  87.5 
 
 		 181 aa  310  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  91.72 
 
 		 169 aa  305  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  86.39 
 
 		 165 aa  302  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  85.21 
 
 		 165 aa  299  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  91.76 
 
 		 170 aa  298  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  86.88 
 
 		 162 aa  295  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  86.25 
 
 		 162 aa  295  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  86.25 
 
 		 162 aa  294  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  84.02 
 
 		 165 aa  291  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  93.04 
 
 		 170 aa  286  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  83.85 
 
 		 163 aa  284  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  83.85 
 
 		 163 aa  284  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  83.85 
 
 		 163 aa  284  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  87.2 
 
 		 165 aa  283  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  85.71 
 
 		 177 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  85.62 
 
 		 162 aa  276  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  85.62 
 
 		 162 aa  276  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  85.62 
 
 		 162 aa  276  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  85.62 
 
 		 162 aa  276  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  85.62 
 
 		 162 aa  276  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  85.62 
 
 		 162 aa  276  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  85 
 
 		 162 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  85.09 
 
 		 163 aa  276  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  85.71 
 
 		 163 aa  275  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  83.02 
 
 		 162 aa  274  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  84.38 
 
 		 162 aa  274  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  83.97 
 
 		 162 aa  274  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  92.98 
 
 		 171 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  85 
 
 		 162 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  85 
 
 		 162 aa  269  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  85 
 
 		 162 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  83.75 
 
 		 162 aa  269  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  84.38 
 
 		 162 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  84.38 
 
 		 162 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  84.38 
 
 		 162 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  78.48 
 
 		 161 aa  265  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  83.02 
 
 		 163 aa  262  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  76.88 
 
 		 162 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  73.75 
 
 		 163 aa  256  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  80.62 
 
 		 163 aa  256  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  73.91 
 
 		 163 aa  256  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  73.91 
 
 		 163 aa  256  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  75 
 
 		 163 aa  254  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  73.75 
 
 		 162 aa  249  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  69.81 
 
 		 163 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  73.75 
 
 		 162 aa  234  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  82.71 
 
 		 162 aa  229  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  69.57 
 
 		 163 aa  228  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0277  NADH dehydrogenase subunit I  74.36 
 
 		 162 aa  221  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.587133  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0248  NADH dehydrogenase subunit I  74.36 
 
 		 162 aa  221  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  65.62 
 
 		 163 aa  219  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2823  NADH dehydrogenase subunit I  72.44 
 
 		 162 aa  216  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0530625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01295  NADH dehydrogenase subunit I  72.44 
 
 		 162 aa  215  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2828  NADH dehydrogenase subunit I  75 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2697  NADH dehydrogenase subunit I  75 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  64.97 
 
 		 161 aa  208  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  63.52 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  65.16 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  63.64 
 
 		 164 aa  205  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  64.29 
 
 		 167 aa  204  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  63.64 
 
 		 167 aa  205  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  62.11 
 
 		 163 aa  204  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  64.29 
 
 		 167 aa  203  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  64.29 
 
 		 167 aa  203  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  63.16 
 
 		 163 aa  201  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  66.46 
 
 		 161 aa  201  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  62.34 
 
 		 164 aa  200  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  60.65 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  64.94 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  63.12 
 
 		 168 aa  198  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  62.58 
 
 		 163 aa  198  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  63.12 
 
 		 163 aa  198  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  67.53 
 
 		 162 aa  197  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  62.58 
 
 		 162 aa  197  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  62.58 
 
 		 163 aa  197  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  62.58 
 
 		 163 aa  197  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  61.94 
 
 		 163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  60.26 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  60.87 
 
 		 163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  62.58 
 
 		 163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  61.29 
 
 		 162 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  61.29 
 
 		 162 aa  193  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  61.04 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 		 162 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 		 162 aa  190  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  59.01 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  54.76 
 
 		 169 aa  189  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  60.65 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  59.35 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  58.44 
 
 		 226 aa  189  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  62.42 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  61.29 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  60.65 
 
 		 162 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  59.35 
 
 		 162 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  59.35 
 
 		 162 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  56.17 
 
 		 164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  59.35 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>