More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2740 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
401 aa  783    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
983 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 
984 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 
960 aa  203  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
376 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
389 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
389 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
394 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
374 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
390 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  29.92 
 
 
390 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 
386 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 
385 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
396 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
428 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
382 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
373 aa  146  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
383 aa  145  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
378 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
389 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  30.18 
 
 
377 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 
389 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
394 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
385 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
376 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
378 aa  136  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.08 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 
390 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
389 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
389 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
397 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  31.15 
 
 
375 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
382 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
376 aa  126  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
496 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
500 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
500 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
387 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
492 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 
375 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  30.29 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
382 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
394 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 
439 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 
441 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.21 
 
 
405 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
817 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.73 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
392 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.47 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.31 
 
 
369 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.58 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.58 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  28.54 
 
 
378 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.58 
 
 
369 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
384 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
819 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
806 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
805 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.58 
 
 
369 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
442 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
816 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.85 
 
 
406 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  26.85 
 
 
442 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  26.85 
 
 
442 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
442 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
442 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  26.85 
 
 
442 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  26.85 
 
 
442 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 
387 aa  103  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
378 aa  103  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  22.95 
 
 
369 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.58 
 
 
369 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.58 
 
 
369 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 
442 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
816 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 
383 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  29.95 
 
 
401 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  26.56 
 
 
406 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
823 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
446 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  23.2 
 
 
460 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 
372 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>