223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2685 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  30.35 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  30.94 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  30.94 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.94 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.94 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  30.94 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.94 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.94 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30.65 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  30 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  30.45 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  33.99 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  29.43 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  27.83 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  28.3 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  33.45 
 
 		 338 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  26.45 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  31.83 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  26.13 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  26.13 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  26.45 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  25.81 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 362 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  33.66 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  29.55 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  31.51 
 
 		 319 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  31.51 
 
 		 319 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  31.51 
 
 		 319 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  31.51 
 
 		 319 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  31.51 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  31.85 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  29.37 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  31.07 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  30.07 
 
 		 694 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  31.72 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  30.42 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  30.42 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  30.42 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  30.42 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  30.42 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  32.12 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  29.35 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  30.87 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 322 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  27.96 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3563  hypothetical protein  30.33 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  28.48 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  30.07 
 
 		 700 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3451  transcriptional regulator, DeoR family  29.29 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  27.95 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 313 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  30.87 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  30.87 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  28.48 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  28.48 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  23.99 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  30.06 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  30.43 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  31.56 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  29.84 
 
 		 321 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  27.07 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  29.47 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  29.57 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  29.73 
 
 		 694 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  29.6 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  28.57 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  29.6 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>