46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2587 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  61.12 
 
 
768 aa  710  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  61.38 
 
 
873 aa  930  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  100 
 
 
889 aa  1769  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  58.49 
 
 
770 aa  692  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  47.39 
 
 
1196 aa  667  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  50.33 
 
 
7434 aa  710  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  53.03 
 
 
4830 aa  729  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  51.32 
 
 
768 aa  675  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  52.47 
 
 
819 aa  661  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  57.57 
 
 
764 aa  656  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  54.13 
 
 
756 aa  664  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  58.14 
 
 
790 aa  673  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  58.5 
 
 
781 aa  674  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  51.29 
 
 
3864 aa  719  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  55.01 
 
 
777 aa  635  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  57.41 
 
 
763 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  45.9 
 
 
860 aa  626  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  63.18 
 
 
465 aa  528  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  43.99 
 
 
846 aa  335  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  38.07 
 
 
954 aa  325  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  39.19 
 
 
918 aa  322  2e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  76.26 
 
 
479 aa  295  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  47.85 
 
 
3340 aa  280  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  48.04 
 
 
4428 aa  277  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  51.47 
 
 
1641 aa  266  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  46.59 
 
 
2796 aa  250  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3607  hypothetical protein  81.38 
 
 
145 aa  246  2e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615518  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.05 
 
 
2156 aa  233  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  38.12 
 
 
3066 aa  222  2e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  48.94 
 
 
1099 aa  162  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  32.5 
 
 
5442 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  35.59 
 
 
1526 aa  123  2e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  43.86 
 
 
308 aa  112  4e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  29.45 
 
 
2768 aa  106  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  35.06 
 
 
4697 aa  91.3  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  28.96 
 
 
1699 aa  73.2  2e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  30.52 
 
 
1151 aa  69.7  3e-10  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  40.35 
 
 
2839 aa  67.4  1e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  43.12 
 
 
2193 aa  66.2  3e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  34.06 
 
 
1827 aa  59.3  3e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  39.35 
 
 
2927 aa  57.8  8e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  25.38 
 
 
2886 aa  50.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  25.51 
 
 
1359 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  26.07 
 
 
4480 aa  49.3  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  29.14 
 
 
746 aa  48.5  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.72 
 
 
1627 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4285e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>