More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2585 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  76.52 
 
 
590 aa  885  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  71.84 
 
 
608 aa  845  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  59.94 
 
 
631 aa  699  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  60.68 
 
 
623 aa  724  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.22 
 
 
623 aa  720  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.22 
 
 
623 aa  720  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.06 
 
 
623 aa  719  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  59.39 
 
 
656 aa  710  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  59.23 
 
 
629 aa  706  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  61.69 
 
 
612 aa  756  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.32 
 
 
651 aa  738  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  59.69 
 
 
606 aa  686  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  61 
 
 
623 aa  714  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  58.48 
 
 
607 aa  737  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  70.73 
 
 
619 aa  841  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  60.68 
 
 
623 aa  713  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  57.78 
 
 
607 aa  731  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  73.51 
 
 
608 aa  843  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  61.65 
 
 
623 aa  723  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  72.28 
 
 
621 aa  841  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  76.75 
 
 
603 aa  897  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.06 
 
 
623 aa  719  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  60.52 
 
 
623 aa  711  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2585  ABC transporter related  100 
 
 
637 aa  1283  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.695823  decreased coverage  0.00374434 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  60.52 
 
 
623 aa  723  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  60.68 
 
 
623 aa  724  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  74.49 
 
 
621 aa  882  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.06 
 
 
623 aa  719  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  61.6 
 
 
630 aa  731  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4026  ABC transporter-related protein  69.24 
 
 
619 aa  774  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.36263e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0803  ABC transporter related  61.55 
 
 
624 aa  674  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.253517  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  61.69 
 
 
612 aa  756  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  61.58 
 
 
629 aa  748  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  59.93 
 
 
605 aa  694  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  9.8516e-08 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  57.4 
 
 
622 aa  684  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  55.12 
 
 
606 aa  636  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.06 
 
 
623 aa  719  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  69.94 
 
 
625 aa  866  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 
592 aa  749  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  59.94 
 
 
654 aa  730  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  56.43 
 
 
593 aa  687  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  76.1 
 
 
603 aa  913  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  54.81 
 
 
615 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  52.31 
 
 
652 aa  616  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  52.77 
 
 
603 aa  613  1e-174  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  51.8 
 
 
612 aa  614  1e-174  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  51.64 
 
 
612 aa  612  1e-174  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  52.84 
 
 
597 aa  612  1e-174  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  52.91 
 
 
646 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  52.51 
 
 
606 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  51.24 
 
 
655 aa  606  1e-172  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  51.73 
 
 
651 aa  608  1e-172  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  50.86 
 
 
655 aa  608  1e-172  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  51.51 
 
 
589 aa  606  1e-172  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  53.55 
 
 
595 aa  602  1e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  50.97 
 
 
661 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  51.29 
 
 
640 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  52.36 
 
 
607 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  50.89 
 
 
644 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  51.05 
 
 
617 aa  596  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  51.79 
 
 
652 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  50.25 
 
 
596 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  51.11 
 
 
662 aa  594  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  50.25 
 
 
596 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  50.25 
 
 
631 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  50 
 
 
663 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.99 
 
 
602 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  51.41 
 
 
647 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  51.07 
 
 
657 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  51.55 
 
 
610 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  51.07 
 
 
651 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  50 
 
 
591 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  50.58 
 
 
672 aa  585  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  50.25 
 
 
594 aa  582  1e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  48.81 
 
 
591 aa  585  1e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.67 
 
 
625 aa  583  1e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.75 
 
 
628 aa  583  1e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  49.03 
 
 
628 aa  584  1e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  50.34 
 
 
598 aa  583  1e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  52.3 
 
 
654 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3236  ABC transporter related  49.5 
 
 
598 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00224105  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  50.08 
 
 
596 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  48.64 
 
 
590 aa  579  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 
596 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  51.49 
 
 
611 aa  580  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  49.83 
 
 
577 aa  580  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2899  ABC transporter related  47.96 
 
 
601 aa  577  1e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0186152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3826  ABC transporter related  49.75 
 
 
598 aa  576  1e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.094291  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  49.75 
 
 
598 aa  577  1e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.89772e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  49.75 
 
 
598 aa  576  1e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  49.92 
 
 
598 aa  578  1e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3300  ABC transporter related  50.25 
 
 
609 aa  577  1e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0999456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  48.1 
 
 
597 aa  578  1e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1701  ABC transporter related  48.53 
 
 
598 aa  573  1e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.09 
 
 
627 aa  574  1e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 
590 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.75 
 
 
628 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  49.83 
 
 
624 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0659  ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 
594 aa  571  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.75742e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  49.43 
 
 
672 aa  565  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>