81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2565 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_51910  Ankyrin  55.86 
 
 
954 aa  1011  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2565  ankyrin  100 
 
 
973 aa  1986  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00388007  normal  0.0998723 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1796  ankyrin  45.82 
 
 
1047 aa  811  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  6.002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5127  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.84 
 
 
932 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1421 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  28.03 
 
 
700 aa  75.9  4e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 
663 aa  67.4  1e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 
809 aa  66.6  2e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 
697 aa  62.8  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  25.86 
 
 
710 aa  60.8  1e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  25.47 
 
 
695 aa  59.7  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  3.85426e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.37 
 
 
1107 aa  59.7  2e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  26.67 
 
 
712 aa  59.3  4e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  23.43 
 
 
695 aa  59.3  4e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  22.53 
 
 
564 aa  58.5  6e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  2.4327e-05 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  26.69 
 
 
708 aa  56.6  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 
742 aa  56.2  3e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  25.86 
 
 
335 aa  55.8  4e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  30.28 
 
 
734 aa  55.1  6e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.56 
 
 
696 aa  54.3  1e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 
751 aa  54.3  1e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  24.1 
 
 
759 aa  52.8  3e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  24.22 
 
 
757 aa  52.4  4e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.44 
 
 
698 aa  52  6e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  21.02 
 
 
681 aa  51.6  7e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  22.73 
 
 
735 aa  50.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.45 
 
 
716 aa  50.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.19 
 
 
706 aa  49.3  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  30.6 
 
 
1127 aa  49.3  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0675  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 
599 aa  48.9  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.771705 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  27.1 
 
 
797 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  27.1 
 
 
797 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.84 
 
 
828 aa  48.5  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  42.19 
 
 
236 aa  48.5  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  42.19 
 
 
236 aa  48.5  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  42.19 
 
 
236 aa  48.5  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 
726 aa  48.5  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 
720 aa  48.1  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  42.19 
 
 
235 aa  48.1  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.51 
 
 
669 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  26.8 
 
 
723 aa  48.1  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0070  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.04 
 
 
671 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.31 
 
 
706 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 
687 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  24.12 
 
 
711 aa  47.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.51 
 
 
682 aa  47.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  24.07 
 
 
703 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  32.03 
 
 
236 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  24.07 
 
 
703 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3473  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.93 
 
 
669 aa  46.6  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.406551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3201  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.82 
 
 
682 aa  46.6  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 
668 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  27.74 
 
 
750 aa  46.2  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  25.45 
 
 
722 aa  46.2  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0631  ankyrin repeat-containing protein  45.45 
 
 
504 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.58922e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  42.19 
 
 
236 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  22.99 
 
 
629 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.56 
 
 
736 aa  45.8  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  24.21 
 
 
723 aa  45.8  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  5.46872e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  42.19 
 
 
236 aa  45.8  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 
686 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.59 
 
 
670 aa  45.4  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  28.26 
 
 
685 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  36.9 
 
 
240 aa  45.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.42 
 
 
669 aa  45.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 
717 aa  45.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 
702 aa  45.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  43.75 
 
 
257 aa  45.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 
719 aa  45.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  41.67 
 
 
750 aa  45.1  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2853  hypothetical protein  28.41 
 
 
1029 aa  45.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 
689 aa  45.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  27.27 
 
 
708 aa  45.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0092  helicase, UvrD/Rep family  19.58 
 
 
666 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  27.22 
 
 
690 aa  44.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  24.28 
 
 
716 aa  44.7  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.33 
 
 
1089 aa  44.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.22 
 
 
672 aa  44.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  29.31 
 
 
680 aa  44.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 
687 aa  44.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  27.54 
 
 
686 aa  44.3  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>