280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2553 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
372 aa  764  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  4.3545e-07  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  79.18 
 
 
351 aa  569  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  76.5 
 
 
348 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  81.9 
 
 
349 aa  544  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  81.6 
 
 
347 aa  540  1e-152  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  75 
 
 
347 aa  528  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  76.45 
 
 
347 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  74.17 
 
 
352 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  73.09 
 
 
352 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  65.17 
 
 
351 aa  467  1e-130  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  68.71 
 
 
347 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  56.06 
 
 
337 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  53.3 
 
 
337 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  51.3 
 
 
337 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  51.37 
 
 
349 aa  329  6e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  49.7 
 
 
353 aa  308  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  45.75 
 
 
340 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  44.41 
 
 
365 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  44.41 
 
 
365 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  45.72 
 
 
341 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  44.74 
 
 
341 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  47.13 
 
 
366 aa  285  9e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  44.58 
 
 
350 aa  284  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  42.32 
 
 
355 aa  284  2e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  43.98 
 
 
350 aa  284  2e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  43.15 
 
 
336 aa  282  5e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  45.09 
 
 
342 aa  281  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  41.88 
 
 
339 aa  276  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  44.04 
 
 
348 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  43.03 
 
 
335 aa  266  3e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  2.37726e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  45.45 
 
 
347 aa  257  3e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.43 
 
 
335 aa  257  3e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
347 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  3.11792e-08 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.87 
 
 
334 aa  256  5e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
346 aa  254  1e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  40.67 
 
 
353 aa  254  2e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  40.25 
 
 
334 aa  253  5e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
355 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  43.64 
 
 
345 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.63 
 
 
334 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 
349 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  45 
 
 
346 aa  249  5e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  39.17 
 
 
349 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  41.3 
 
 
338 aa  240  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  41.43 
 
 
334 aa  240  3e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  41.36 
 
 
338 aa  239  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  41.36 
 
 
380 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 
338 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  42.17 
 
 
362 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  41.21 
 
 
336 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  41.16 
 
 
339 aa  236  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  37.38 
 
 
336 aa  235  9e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  39 
 
 
337 aa  234  2e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  41.61 
 
 
338 aa  234  2e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 
345 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.25 
 
 
351 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.25 
 
 
351 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  40.99 
 
 
338 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 
337 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  2.21625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  42.55 
 
 
351 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  41.1 
 
 
347 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.25 
 
 
351 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.25 
 
 
351 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  42.25 
 
 
351 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  42.25 
 
 
351 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  41.14 
 
 
347 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  40.4 
 
 
337 aa  229  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
337 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  38.6 
 
 
337 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.22094e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.06 
 
 
336 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  41.46 
 
 
341 aa  228  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  40.84 
 
 
347 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  39.88 
 
 
335 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 
347 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 
347 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  39.75 
 
 
336 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  37.17 
 
 
339 aa  226  5e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  37.18 
 
 
352 aa  226  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.86976e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 
345 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  40.8 
 
 
347 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 
336 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 
347 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  37.46 
 
 
348 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 
351 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  38.01 
 
 
337 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  38.6 
 
 
349 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  39.18 
 
 
335 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  38.66 
 
 
335 aa  223  5e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 
347 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 
335 aa  221  2e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 
335 aa  221  2e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 
335 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  41.36 
 
 
345 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  38.3 
 
 
335 aa  219  9e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  34.77 
 
 
350 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 
335 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 
374 aa  218  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  40.18 
 
 
354 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  38.82 
 
 
333 aa  217  3e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  36.36 
 
 
374 aa  216  7e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>