More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2535 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 323 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  95.96 
 
 		 323 aa  622  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  95.36 
 
 		 323 aa  620  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  87.31 
 
 		 323 aa  568  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  92 
 
 		 238 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  60.06 
 
 		 333 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  60.06 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  60.25 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  60.06 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  56.31 
 
 		 329 aa  347  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  56.31 
 
 		 325 aa  347  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  56 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  52.87 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  56 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  56.17 
 
 		 497 aa  345  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 325 aa  346  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  56.17 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  56.17 
 
 		 333 aa  345  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  55.86 
 
 		 325 aa  345  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  55.69 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  55.86 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  84.5 
 
 		 216 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  84.5 
 
 		 216 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  59.81 
 
 		 229 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  39.32 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  37.19 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  38.51 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  38.51 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  38.17 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  38.51 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  37.87 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  35.33 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  35.33 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  35.33 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  35.33 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  35.33 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  35.33 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  38.21 
 
 		 348 aa  186  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  38.21 
 
 		 355 aa  185  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  37.7 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  37.7 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  43.85 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  35.78 
 
 		 321 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  60.36 
 
 		 179 aa  180  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  35.67 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  37.58 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  35.78 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  35.78 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  36.86 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  35.95 
 
 		 463 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  33.74 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  33.74 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  33.74 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  33.74 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  33.74 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  33.74 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  33.85 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  33.85 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  33.44 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  33.33 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  36.14 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  34.97 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  34.97 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  34.97 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  34.97 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  35.79 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  39.78 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  36.69 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  39.48 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  35.56 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  35.71 
 
 		 286 aa  133  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00517  transposase  81.08 
 
 		 115 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  35.24 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  39.23 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0408  transposase  90.16 
 
 		 100 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  34.63 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  32.76 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  34.76 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  34.76 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  34.76 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  33.62 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  29.92 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  36.95 
 
 		 206 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  32.34 
 
 		 289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2626  transcriptional regulator, putative  32.03 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1454  transcriptional regulator, putative  33.77 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1420  transcriptional regulator, putative  33.77 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1426  transcriptional regulator, putative  33.77 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2928  transcriptional regulator, putative  33.77 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  43.75 
 
 		 157 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  30.3 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  30.3 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3105  hypothetical protein  31.98 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  37.91 
 
 		 178 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2834  hypothetical protein  76.12 
 
 		 93 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  35.11 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  37.89 
 
 		 188 aa  99.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1116  transcriptional regulator, putative  31.51 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  28.4 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  28.4 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>