More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2447 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  100 
 
 
238 aa  504  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  95.57 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  95.54 
 
 
323 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  92 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  87.06 
 
 
323 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  65.99 
 
 
321 aa  288  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  65.99 
 
 
463 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  65.82 
 
 
333 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  65.82 
 
 
321 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  53.28 
 
 
325 aa  257  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  53.54 
 
 
325 aa  255  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  57.73 
 
 
229 aa  251  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  58.38 
 
 
325 aa  248  9e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  57.87 
 
 
329 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  57.87 
 
 
325 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  58.16 
 
 
441 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  58.16 
 
 
497 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  58.16 
 
 
327 aa  245  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  58.16 
 
 
333 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  57.65 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  57.65 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  53.47 
 
 
329 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  82.67 
 
 
216 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  82.67 
 
 
216 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00517  transposase  82.43 
 
 
115 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0408  transposase  95.08 
 
 
100 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  36.84 
 
 
330 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  36.84 
 
 
330 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  36.89 
 
 
330 aa  125  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  36.89 
 
 
330 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  36.89 
 
 
330 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  40.1 
 
 
330 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  37.56 
 
 
323 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  36.4 
 
 
348 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  36.4 
 
 
355 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  38.42 
 
 
343 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  38.42 
 
 
332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
316 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
316 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
316 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
316 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  34.47 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  35.08 
 
 
320 aa  115  5e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  48.51 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  34.1 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  34.23 
 
 
463 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  34.55 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  37.37 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  34.22 
 
 
320 aa  108  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  109  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  32.38 
 
 
321 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  35.64 
 
 
280 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2834  hypothetical protein  76.12 
 
 
93 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  35.63 
 
 
259 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.37 
 
 
265 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  30.88 
 
 
316 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  30.88 
 
 
316 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  30.88 
 
 
316 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  30.88 
 
 
316 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  30.88 
 
 
316 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  30.88 
 
 
316 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  30.88 
 
 
316 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  31.8 
 
 
319 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  31.8 
 
 
319 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  31.8 
 
 
319 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  31.8 
 
 
319 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  30.56 
 
 
327 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  30.56 
 
 
316 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  33.52 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  35.54 
 
 
284 aa  99.4  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  33.52 
 
 
329 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  33.52 
 
 
329 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  33.52 
 
 
329 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  34.68 
 
 
216 aa  95.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4133  transposase  64.62 
 
 
110 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.261032  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  40.3 
 
 
303 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3134  hypothetical protein  88.89 
 
 
134 aa  88.2  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155985  normal  0.0526505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0469  hypothetical protein  78.26 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  28.18 
 
 
316 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  28.18 
 
 
316 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  28.18 
 
 
316 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  28.18 
 
 
316 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  71.74 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  28.18 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  28.64 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  32.19 
 
 
153 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  45 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  29.19 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  29.19 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  29.19 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  29.19 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  29.19 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0690  Integrase catalytic region  28.3 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168341  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  28.48 
 
 
374 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  28.48 
 
 
375 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 
315 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>