78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2316 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2316    100 
 
 
1061 bp  2103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000290431  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  98.77 
 
 
1545 bp  307  3e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  98.77 
 
 
522 bp  307  3e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  98.77 
 
 
504 bp  307  3e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  98.77 
 
 
1545 bp  307  3e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  98.77 
 
 
519 bp  307  3e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  98.16 
 
 
6603 bp  299  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3387    98.16 
 
 
309 bp  299  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0582875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  97.02 
 
 
9828 bp  293  5e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  97.02 
 
 
315 bp  293  5e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  97.55 
 
 
519 bp  291  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  97.55 
 
 
303 bp  291  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  97.55 
 
 
1158 bp  291  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  97.55 
 
 
1569 bp  291  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  97.55 
 
 
339 bp  291  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  97.55 
 
 
366 bp  291  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0363  hypothetical protein  97.56 
 
 
294 bp  285  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2103    97.5 
 
 
282 bp  285  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.531773  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  96.93 
 
 
1011 bp  283  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  96.93 
 
 
1185 bp  283  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  96.93 
 
 
915 bp  283  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  96.93 
 
 
834 bp  283  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  98.69 
 
 
330 bp  280  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  98.69 
 
 
399 bp  280  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3787  hypothetical protein  98.69 
 
 
408 bp  280  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0425  hypothetical protein  98.03 
 
 
240 bp  278  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0375    97.48 
 
 
159 bp  276  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.851107  normal  0.316386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  96.32 
 
 
318 bp  276  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1094  hypothetical protein  98.04 
 
 
294 bp  272  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0968333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1997  hypothetical protein  98.04 
 
 
240 bp  272  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.570421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  98.04 
 
 
450 bp  272  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1657    96.34 
 
 
755 bp  270  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.625202  normal  0.215657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0341  hypothetical protein  98.63 
 
 
315 bp  266  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  97.39 
 
 
297 bp  264  5e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2056  hypothetical protein  97.39 
 
 
471 bp  264  5e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1020  hypothetical protein  97.39 
 
 
267 bp  264  5e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1891  hypothetical protein  97.3 
 
 
240 bp  262  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.286259  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  96.67 
 
 
918 bp  258  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3629  hypothetical protein  97.95 
 
 
303 bp  258  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1527  hypothetical protein  97.95 
 
 
285 bp  258  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124431  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4768  hypothetical protein  96.73 
 
 
318 bp  256  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1161  hypothetical protein  96.73 
 
 
288 bp  256  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3831  hypothetical protein  96.71 
 
 
315 bp  254  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  95.73 
 
 
1749 bp  254  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  95.73 
 
 
432 bp  254  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1701  hypothetical protein  96.08 
 
 
309 bp  248  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  97.24 
 
 
1692 bp  248  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  96.55 
 
 
378 bp  240  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2214  hypothetical protein  95.48 
 
 
243 bp  236  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  95.86 
 
 
630 bp  232  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  93.79 
 
 
579 bp  216  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3061  hypothetical protein  97.17 
 
 
336 bp  186  9e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.341918  normal  0.0301074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2169  hypothetical protein  98.95 
 
 
246 bp  180  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.91364  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1122    87.95 
 
 
168 bp  172  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2997  hypothetical protein  96.91 
 
 
471 bp  168  2e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0932717  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2342  hypothetical protein  96.84 
 
 
300 bp  165  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4508  hypothetical protein  97.18 
 
 
288 bp  125  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.619373  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  97.18 
 
 
429 bp  125  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  97.06 
 
 
1734 bp  119  2e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  86.23 
 
 
1623 bp  115  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  85.4 
 
 
1599 bp  113  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4444  hypothetical protein  98.36 
 
 
282 bp  113  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  87.93 
 
 
1701 bp  111  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4257  hypothetical protein  96.72 
 
 
243 bp  105  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.751318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0580    96.72 
 
 
306 bp  105  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  83.94 
 
 
1599 bp  97.6  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  8.68135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2836  hypothetical protein  95.08 
 
 
387 bp  97.6  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  82.04 
 
 
1590 bp  93.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3216  hypothetical protein  97.87 
 
 
684 bp  85.7  2e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0618648  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4860  histidine biosynthesis  97.83 
 
 
690 bp  83.8  9e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155368  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  97.83 
 
 
975 bp  83.8  9e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4212  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  97.73 
 
 
1434 bp  79.8  1e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0207401  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4887  putative cAMP phosphodiesterase  95.65 
 
 
423 bp  75.8  2e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  93.48 
 
 
573 bp  67.9  6e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3510  hypothetical protein  93.48 
 
 
291 bp  67.9  6e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0575334  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4769  fatty acid desaturase  91.3 
 
 
918 bp  60  1e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.237988  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  82.11 
 
 
1587 bp  54  8e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.74141e-05  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2317  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
1734 bp  50.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000660046  normal  0.503814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>