More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2282 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2282  response regulator receiver protein  100 
 
 
276 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2035  response regulator receiver protein  66.44 
 
 
282 aa  342  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.150352  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  67.02 
 
 
276 aa  338  8e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3613  two component transcriptional regulator, LytTR family  63.93 
 
 
281 aa  326  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2262  LytTR family two component transcriptional regulator  61.68 
 
 
269 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0894174 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  67.5 
 
 
295 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  45.2 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  46.76 
 
 
270 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  45.36 
 
 
273 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.55 
 
 
277 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.91 
 
 
277 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.75 
 
 
256 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  41.01 
 
 
261 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  41.76 
 
 
279 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  39.49 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  39.13 
 
 
263 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1400  response regulator  41.73 
 
 
243 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6684  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.7 
 
 
243 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2603  response regulator  39.11 
 
 
243 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  35.21 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  30.69 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
265 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  31.62 
 
 
268 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.77 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  30.88 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.3 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  32.95 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.18 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  28.99 
 
 
273 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  32.77 
 
 
243 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  33.45 
 
 
245 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.37 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  31.21 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0231  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  31.25 
 
 
280 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3679  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
262 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  27.9 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.18 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.71 
 
 
260 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.84 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  31.73 
 
 
252 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  28.37 
 
 
275 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  33.21 
 
 
255 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  26.67 
 
 
254 aa  112  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0036  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
248 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  33.88 
 
 
243 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  28.74 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0930  response regulator receiver protein  33.21 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  33.08 
 
 
243 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1435  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.27 
 
 
264 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.314663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  31.75 
 
 
248 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.03 
 
 
265 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2329  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.66 
 
 
236 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0108361  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
245 aa  106  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3531  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.72 
 
 
243 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1373  DNA-binding response regulator  46.83 
 
 
300 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.648551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.7 
 
 
244 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1458  DNA-binding response regulator  46.83 
 
 
140 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
255 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0388  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.64 
 
 
233 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  31.03 
 
 
252 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  29.5 
 
 
243 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  33.57 
 
 
269 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  33.57 
 
 
269 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  29.78 
 
 
268 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1226  LytTR family two component transcriptional regulator  31.03 
 
 
252 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  31.84 
 
 
248 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.12 
 
 
243 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2656  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.41 
 
 
250 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81917  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 
261 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  31.06 
 
 
248 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.89 
 
 
241 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  31.39 
 
 
248 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4386  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.27 
 
 
260 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  26.79 
 
 
231 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
258 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1130  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.86 
 
 
238 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3149  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.6 
 
 
238 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  33.57 
 
 
269 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  27.88 
 
 
260 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.19 
 
 
238 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.19 
 
 
238 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  31.85 
 
 
242 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
252 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  31.06 
 
 
248 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.63 
 
 
237 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.04 
 
 
244 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  28.74 
 
 
243 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  31.18 
 
 
268 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  28.74 
 
 
243 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3341  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.78 
 
 
244 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.19 
 
 
238 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  29.12 
 
 
243 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  29.12 
 
 
243 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.11 
 
 
251 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  29.78 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
254 aa  99.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>