More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2280 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.6 
 
 
287 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  58.57 
 
 
291 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  58.57 
 
 
291 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.57 
 
 
288 aa  356  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.15 
 
 
292 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
274 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
316 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
305 aa  178  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.5 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
311 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.33 
 
 
278 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.4 
 
 
298 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
279 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
288 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
279 aa  169  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
280 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
316 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.28 
 
 
289 aa  168  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0780045  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
285 aa  168  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.37 
 
 
283 aa  168  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
278 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
278 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
277 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
322 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
271 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 
292 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
275 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
283 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
280 aa  165  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565272 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
255 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
273 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
279 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
285 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
283 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  35.79 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  35.79 
 
 
275 aa  161  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
297 aa  161  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
276 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.71 
 
 
283 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.92 
 
 
282 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
286 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
275 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
281 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  35.38 
 
 
272 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0078  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.67 
 
 
293 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
281 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
276 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  32.37 
 
 
275 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
275 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
289 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
273 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
317 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330167  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
275 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
277 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
293 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
283 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
293 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  0.943286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
276 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04600  ABC-type sugar transport system, permease component  34.52 
 
 
295 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.539803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
277 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 
280 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
297 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
288 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
277 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
276 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
276 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
315 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
319 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
280 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
281 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
317 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
280 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
286 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
280 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  30.6 
 
 
280 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  30.6 
 
 
280 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  30.6 
 
 
280 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  30.6 
 
 
280 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
280 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
280 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
280 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1754  putative ABC transporter (permease protein)  38.46 
 
 
274 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.89 
 
 
295 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
292 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0409709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 
293 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>