More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2235 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
330 aa  675    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  84.71 
 
 
328 aa  578  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  85.02 
 
 
328 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  78.72 
 
 
331 aa  537  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  78.66 
 
 
328 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  75.83 
 
 
331 aa  521  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  77.54 
 
 
326 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  74.31 
 
 
344 aa  501  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  72.17 
 
 
327 aa  491  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  72.14 
 
 
331 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.53 
 
 
322 aa  424  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  64 
 
 
324 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.23 
 
 
327 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.42 
 
 
326 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  61.42 
 
 
326 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.23 
 
 
324 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 
324 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
324 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.92 
 
 
324 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  56.62 
 
 
324 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  56 
 
 
324 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  56.31 
 
 
324 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.69 
 
 
324 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.92 
 
 
323 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
324 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  57.01 
 
 
325 aa  368  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
324 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
324 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  54.74 
 
 
325 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 
325 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  56.44 
 
 
325 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  55.83 
 
 
325 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  55.83 
 
 
325 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  56 
 
 
324 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  56 
 
 
324 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.13 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  56 
 
 
327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  56.31 
 
 
323 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.31 
 
 
323 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.31 
 
 
323 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.31 
 
 
324 aa  354  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.91 
 
 
325 aa  354  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  54.29 
 
 
324 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.11 
 
 
322 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  54.91 
 
 
325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.68 
 
 
325 aa  350  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  55.66 
 
 
325 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 
324 aa  349  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  55.69 
 
 
324 aa  348  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 
323 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  55.21 
 
 
325 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  52.58 
 
 
326 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.58 
 
 
326 aa  346  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  56.1 
 
 
324 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  53.68 
 
 
325 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  52.89 
 
 
326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  52.89 
 
 
326 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  51.67 
 
 
326 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.91 
 
 
324 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.44 
 
 
327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.54 
 
 
325 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  51.37 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.85 
 
 
331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  51.68 
 
 
327 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  51.68 
 
 
327 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  51.68 
 
 
327 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  51.68 
 
 
327 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  51.68 
 
 
327 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  51.68 
 
 
327 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.74 
 
 
328 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.85 
 
 
326 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.73 
 
 
322 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.85 
 
 
326 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.04 
 
 
322 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.74 
 
 
327 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
326 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.74 
 
 
327 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.74 
 
 
327 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  51.68 
 
 
327 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.37 
 
 
326 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.44 
 
 
327 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.22 
 
 
327 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50.91 
 
 
327 aa  329  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4639  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.44 
 
 
327 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0687735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50.91 
 
 
327 aa  329  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50.91 
 
 
327 aa  329  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0742  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50.61 
 
 
329 aa  329  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50.91 
 
 
327 aa  328  6e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  50.91 
 
 
327 aa  328  6e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50.91 
 
 
327 aa  328  6e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4544  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50.91 
 
 
327 aa  328  7e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  52.76 
 
 
325 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50.61 
 
 
327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  51.22 
 
 
331 aa  325  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>