35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2170 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2170  poly granule associated family protein  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
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NC_007948  Bpro_4024  poly granule associated  66.92 
 
 
168 aa  167  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3495  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  66.17 
 
 
194 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.827909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3527  poly granule associated  66.96 
 
 
200 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0552  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  53.33 
 
 
157 aa  144  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0490  polygranule-associated protein  55.17 
 
 
182 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394794  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0536  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  52.59 
 
 
157 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.326611  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0350  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  53.02 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1492  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  34.11 
 
 
139 aa  88.2  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0391  Poly granule associated  38.6 
 
 
230 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2543  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  37.93 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00882865  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0389  Poly granule associated  37.07 
 
 
140 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5057  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  36.28 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0457  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  34.19 
 
 
254 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868468  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66880  hypothetical protein  34.48 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5147  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaF  34.87 
 
 
257 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4881  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  33.33 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5800  hypothetical protein  34.48 
 
 
138 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5007  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  34.19 
 
 
261 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.508327  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0390  Poly granule associated  33.33 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5008  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  30.09 
 
 
139 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4882  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  30.09 
 
 
139 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0525  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  34.43 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233444  normal 
 
 
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NC_004578  PSPTO_5148  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaI  33.6 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5058  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  30.97 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010717  PXO_00722  poly(hydroxyalcanoate) granule associated protein  33.1 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176303  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_0526  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.26 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170611  normal 
 
 
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NC_010501  PputW619_0456  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal 
 
 
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NC_010577  XfasM23_0559  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  28.03 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_5799  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  29.92 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0604  poly(hydroxyalcanoate) granule associated protein  26.72 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_66875  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  30.08 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011138  MADE_01151  hypothetical protein  29.79 
 
 
119 aa  48.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_0063  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  27.78 
 
 
159 aa  44.3  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.436738 
 
 
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NC_007908  Rfer_2415  hypothetical protein  27.55 
 
 
177 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471261  n/a   
 
 
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