More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2113 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  639  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  50.64 
 
 
328 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  53.08 
 
 
339 aa  321  8e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  51.35 
 
 
327 aa  321  1e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50.17 
 
 
330 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  52.86 
 
 
328 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50 
 
 
330 aa  316  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  50.17 
 
 
333 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  49.5 
 
 
314 aa  304  1e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  49.67 
 
 
345 aa  302  5e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  47.3 
 
 
328 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  49.67 
 
 
345 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  48.32 
 
 
324 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  47.09 
 
 
333 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  49.51 
 
 
335 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  48.98 
 
 
325 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  48.98 
 
 
327 aa  295  8e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  48.46 
 
 
328 aa  292  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.2 
 
 
331 aa  292  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.66 
 
 
323 aa  291  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  48.25 
 
 
334 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18374e-05 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  48.12 
 
 
328 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  47.06 
 
 
328 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.95 
 
 
318 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  48.67 
 
 
360 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  46.03 
 
 
328 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  46.6 
 
 
327 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.19 
 
 
339 aa  286  3e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  48.83 
 
 
335 aa  283  3e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.27 
 
 
304 aa  283  3e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  47.3 
 
 
322 aa  282  4e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  44.9 
 
 
344 aa  282  6e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.03 
 
 
336 aa  281  7e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46.28 
 
 
331 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.93 
 
 
330 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  50 
 
 
334 aa  278  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  46.18 
 
 
337 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  45.72 
 
 
335 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.63 
 
 
336 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  45.07 
 
 
310 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.93 
 
 
339 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.62 
 
 
325 aa  275  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  44.97 
 
 
356 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.37 
 
 
325 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  47.75 
 
 
328 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.28 
 
 
328 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.7 
 
 
320 aa  273  2e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  44.74 
 
 
330 aa  274  2e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  45.48 
 
 
333 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  45.27 
 
 
325 aa  272  5e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  43.58 
 
 
335 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  45.61 
 
 
331 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.78 
 
 
358 aa  270  3e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  41.9 
 
 
324 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  45.67 
 
 
353 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  46.53 
 
 
322 aa  268  6e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.45 
 
 
326 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  43.14 
 
 
356 aa  268  9e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  4.25301e-06  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.67 
 
 
324 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  43.23 
 
 
325 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.86 
 
 
325 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.29 
 
 
325 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  43.49 
 
 
321 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  43.1 
 
 
324 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  43.88 
 
 
335 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  44.37 
 
 
324 aa  266  3e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  42.58 
 
 
339 aa  266  3e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.09 
 
 
324 aa  266  3e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  45.33 
 
 
328 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  46.82 
 
 
327 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 
326 aa  265  9e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  3.51886e-10  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  44.27 
 
 
323 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  43.64 
 
 
323 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.07 
 
 
325 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.41 
 
 
331 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.45 
 
 
322 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  41.72 
 
 
332 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.54 
 
 
327 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.41 
 
 
331 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 
329 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  47.23 
 
 
330 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  42.14 
 
 
332 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.27 
 
 
320 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  1.0806e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.9 
 
 
334 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43.54 
 
 
335 aa  262  5e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.4 
 
 
322 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  44 
 
 
324 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.04 
 
 
326 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  43.87 
 
 
335 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  46.55 
 
 
330 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  44.48 
 
 
353 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.96 
 
 
322 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  4.67968e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.33 
 
 
328 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  44.14 
 
 
321 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.01 
 
 
332 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.94 
 
 
335 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  42.01 
 
 
322 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.59 
 
 
323 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  43.69 
 
 
322 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  47.14 
 
 
330 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>