More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2075 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2075  HAD family hydrolase  100 
 
 
217 aa  440  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00099021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  34.43 
 
 
235 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.51 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  1.32599e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.65 
 
 
222 aa  98.2  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.74 
 
 
220 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  26.73 
 
 
226 aa  89  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.71478e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  29.51 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.61 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28.26 
 
 
221 aa  84  2e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.66 
 
 
217 aa  83.2  3e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.65 
 
 
219 aa  83.2  3e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  33.52 
 
 
218 aa  83.2  3e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  35.29 
 
 
218 aa  82.8  4e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.58 
 
 
235 aa  82  6e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  38.2 
 
 
735 aa  80.9  1e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  31.67 
 
 
219 aa  80.9  1e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.19514e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.95 
 
 
235 aa  81.3  1e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1268  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
215 aa  80.9  1e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.65 
 
 
209 aa  80.5  2e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20940  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.43 
 
 
273 aa  79.7  3e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  32.29 
 
 
217 aa  79  6e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  34.59 
 
 
229 aa  78.6  7e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2406  HAD family hydrolase  32.97 
 
 
219 aa  77.8  1e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.1338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1843  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.03 
 
 
241 aa  76.6  2e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101722  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  33.51 
 
 
217 aa  76.3  3e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172111  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.58 
 
 
213 aa  75.9  4e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  34.64 
 
 
168 aa  75.9  4e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.77 
 
 
218 aa  75.9  4e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  4.98152e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  28.64 
 
 
456 aa  75.9  4e-13  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  32.11 
 
 
221 aa  75.5  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  27.87 
 
 
217 aa  75.5  6e-13  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
221 aa  75.5  6e-13  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.44 
 
 
225 aa  75.5  6e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
243 aa  74.7  9e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.44 
 
 
210 aa  74.7  9e-13  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 
230 aa  74.7  9e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  31.32 
 
 
271 aa  73.9  1e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  27.87 
 
 
217 aa  74.7  1e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.12 
 
 
227 aa  74.3  1e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  32.46 
 
 
221 aa  74.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  32.46 
 
 
221 aa  74.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  32.46 
 
 
221 aa  74.3  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  27.64 
 
 
456 aa  73.6  2e-12  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  24.49 
 
 
211 aa  73.9  2e-12  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
223 aa  73.9  2e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3210  HAD family hydrolase  32.4 
 
 
228 aa  73.2  3e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.742759  normal  0.278604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  33.73 
 
 
231 aa  72.8  3e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.09 
 
 
234 aa  72.8  3e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3160  HAD family hydrolase  32.4 
 
 
228 aa  73.2  3e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0720917  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.25 
 
 
218 aa  73.2  3e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.1766e-06  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3148  HAD family hydrolase  32.4 
 
 
228 aa  73.2  3e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0274068  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.12 
 
 
231 aa  72.8  4e-12  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3054  HAD family hydrolase  31.55 
 
 
224 aa  72.8  4e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.751068  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.54 
 
 
232 aa  72.4  4e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  31.91 
 
 
221 aa  72.4  4e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  23.47 
 
 
212 aa  72.8  4e-12  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.37 
 
 
224 aa  72  7e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.47 
 
 
217 aa  72  7e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.37 
 
 
219 aa  71.6  8e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  9.65281e-05  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0581  HAD family hydrolase  35.56 
 
 
207 aa  71.6  8e-12  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.696178  normal  0.657435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.48 
 
 
217 aa  71.6  9e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.31 
 
 
230 aa  71.6  9e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.73 
 
 
218 aa  70.9  1e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1175  HAD family hydrolase  34.41 
 
 
263 aa  71.2  1e-11  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.86 
 
 
224 aa  70.9  1e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  24.46 
 
 
220 aa  70.5  2e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.25 
 
 
218 aa  70.1  2e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.4214e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  34.44 
 
 
204 aa  69.7  3e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  34.41 
 
 
224 aa  69.7  3e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03683  putative enzymatic protein  26.88 
 
 
232 aa  70.1  3e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  27.86 
 
 
218 aa  70.1  3e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  28.23 
 
 
218 aa  70.1  3e-11  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
235 aa  70.1  3e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  26.13 
 
 
215 aa  69.7  3e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  26.4 
 
 
242 aa  69.7  3e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  27.41 
 
 
241 aa  69.3  4e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  31.41 
 
 
221 aa  69.3  4e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  25.52 
 
 
212 aa  69.7  4e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  25.4 
 
 
396 aa  69.3  4e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.61 
 
 
223 aa  68.9  5e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  30.16 
 
 
227 aa  68.9  5e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.35 
 
 
231 aa  68.6  7e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  27.86 
 
 
214 aa  68.2  8e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.84 
 
 
248 aa  68.2  8e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  27.55 
 
 
216 aa  68.2  8e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.83 
 
 
247 aa  68.2  9e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2349  HAD family hydrolase  32.53 
 
 
215 aa  68.2  9e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  29.28 
 
 
213 aa  68.2  9e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  25.52 
 
 
216 aa  68.2  1e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.32 
 
 
219 aa  67.4  1e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.43869e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  26.9 
 
 
223 aa  67.8  1e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.32 
 
 
219 aa  67.8  1e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.38408e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2837  putative phosphatase  32.26 
 
 
219 aa  67.4  1e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.390104  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.96 
 
 
245 aa  67.8  1e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4808e-10 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.03 
 
 
202 aa  67  2e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  30.58 
 
 
221 aa  67  2e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.33 
 
 
231 aa  66.6  2e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  28.8 
 
 
230 aa  67  2e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  25.52 
 
 
216 aa  67  2e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
456 aa  67  2e-10  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  8.52801e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>