More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2072 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  531  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  71.76 
 
 
262 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  75.42 
 
 
261 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  69.88 
 
 
257 aa  358  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  65.45 
 
 
263 aa  355  3e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  67.72 
 
 
263 aa  344  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  63.22 
 
 
263 aa  343  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  64.09 
 
 
268 aa  343  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  67.34 
 
 
262 aa  337  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  63.03 
 
 
263 aa  321  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  51.49 
 
 
256 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  48.77 
 
 
246 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  46.86 
 
 
205 aa  191  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  44.12 
 
 
254 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  46.72 
 
 
242 aa  188  6e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  48.1 
 
 
246 aa  182  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  48.51 
 
 
227 aa  181  8e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  43.19 
 
 
249 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  38.04 
 
 
282 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  36.68 
 
 
247 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  40.09 
 
 
263 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  38.03 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  39.13 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  36.8 
 
 
259 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  6.43093e-05  hitchhiker  1.56191e-14 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  38.46 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  38.81 
 
 
251 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  39.57 
 
 
244 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  40 
 
 
251 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  37.71 
 
 
242 aa  141  1e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  40 
 
 
257 aa  140  2e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  37.05 
 
 
249 aa  139  4e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  37.18 
 
 
258 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  40.76 
 
 
257 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  36.8 
 
 
262 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  37.66 
 
 
282 aa  136  3e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  35.9 
 
 
266 aa  136  3e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  36.68 
 
 
257 aa  136  3e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  34.98 
 
 
262 aa  135  6e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  39.44 
 
 
282 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  35.4 
 
 
259 aa  134  2e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  38.46 
 
 
281 aa  133  2e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  38.24 
 
 
243 aa  134  2e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  35.62 
 
 
264 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  39.25 
 
 
264 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  36.28 
 
 
259 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  35.96 
 
 
259 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  40.87 
 
 
271 aa  131  1e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  34.98 
 
 
251 aa  130  2e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  36.02 
 
 
256 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  36.24 
 
 
261 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  34.96 
 
 
260 aa  129  5e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  37.33 
 
 
256 aa  129  5e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 
254 aa  129  5e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  35.98 
 
 
258 aa  128  8e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  35.39 
 
 
259 aa  128  8e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  37.56 
 
 
251 aa  128  8e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  37.61 
 
 
258 aa  128  9e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  36.93 
 
 
268 aa  128  1e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  36.99 
 
 
331 aa  127  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  38.21 
 
 
252 aa  127  2e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  36.99 
 
 
322 aa  127  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  36.44 
 
 
264 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  37.1 
 
 
267 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  37.61 
 
 
257 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  37.61 
 
 
257 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  36.82 
 
 
261 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  33.48 
 
 
262 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  36.99 
 
 
250 aa  126  4e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 
257 aa  126  4e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  40.17 
 
 
258 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  36.92 
 
 
250 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  36.32 
 
 
257 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  36.9 
 
 
261 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  37.24 
 
 
261 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  35.94 
 
 
255 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  36.02 
 
 
258 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  36.16 
 
 
253 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  35.81 
 
 
261 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  34.77 
 
 
271 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  36.32 
 
 
241 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  36.19 
 
 
255 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  34.63 
 
 
277 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  38.16 
 
 
260 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  36.84 
 
 
277 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  38.46 
 
 
257 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  34.3 
 
 
265 aa  121  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  35.75 
 
 
254 aa  122  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  33.02 
 
 
255 aa  121  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  36.17 
 
 
312 aa  121  1e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  36.32 
 
 
252 aa  121  1e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  35.71 
 
 
255 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  35.71 
 
 
255 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  37.07 
 
 
263 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  33.93 
 
 
260 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  36.17 
 
 
268 aa  119  4e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  32.85 
 
 
250 aa  119  4e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  36.45 
 
 
271 aa  119  5e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  3.07771e-05 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  32.03 
 
 
264 aa  119  5e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  34.93 
 
 
257 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  37.73 
 
 
244 aa  117  1e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>