103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2030 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  221  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  96.3 
 
 
132 aa  105  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  98.04 
 
 
149 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1094  hypothetical protein  86.21 
 
 
97 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0968333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2056  hypothetical protein  80.65 
 
 
156 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3787  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  62.77 
 
 
98 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1997  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.570421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1701  hypothetical protein  90.38 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1020  hypothetical protein  96.08 
 
 
88 aa  96.7  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1161  hypothetical protein  96 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4768  hypothetical protein  72 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  90.48 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  70.37 
 
 
582 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  56 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  57.14 
 
 
312 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  75.56 
 
 
522 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  36.36 
 
 
304 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  57.14 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  57.14 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  57.14 
 
 
313 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  57.14 
 
 
313 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  57.14 
 
 
316 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  57.14 
 
 
313 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  57.14 
 
 
313 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  49.09 
 
 
306 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  75 
 
 
3275 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  53.42 
 
 
394 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  50.94 
 
 
304 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  61.4 
 
 
385 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  50 
 
 
303 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  52 
 
 
316 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  49.06 
 
 
304 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  52.83 
 
 
303 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  79.49 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  79.49 
 
 
304 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  78.05 
 
 
2200 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  79.49 
 
 
277 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54.35 
 
 
300 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  42.25 
 
 
308 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  77.5 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  79.49 
 
 
336 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  74.42 
 
 
173 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  49.06 
 
 
303 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  73.81 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  75 
 
 
167 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  75 
 
 
514 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  66.67 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  76.92 
 
 
514 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  44.64 
 
 
304 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  76.32 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  76.32 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  75 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  76.32 
 
 
112 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  55.1 
 
 
316 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  48.21 
 
 
296 aa  53.9  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  44.23 
 
 
308 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  81.82 
 
 
209 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0425  hypothetical protein  89.29 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439852  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.27 
 
 
563 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  73.68 
 
 
305 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  43.75 
 
 
318 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40 
 
 
310 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  54 
 
 
315 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  46.94 
 
 
350 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  33.33 
 
 
304 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  47.17 
 
 
372 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  51.02 
 
 
312 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  46.15 
 
 
302 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  45.28 
 
 
366 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  44.9 
 
 
332 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  42.86 
 
 
362 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  40.82 
 
 
342 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  60 
 
 
302 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  73.68 
 
 
192 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  29.89 
 
 
295 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  46.94 
 
 
357 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  46.94 
 
 
310 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  48.98 
 
 
324 aa  47.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  48 
 
 
322 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.82 
 
 
368 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  43.4 
 
 
363 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  40.82 
 
 
352 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  49.02 
 
 
327 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  46.94 
 
 
340 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  42.11 
 
 
323 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  40.82 
 
 
353 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1891  hypothetical protein  80 
 
 
79 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.286259  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  44.74 
 
 
328 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  38.3 
 
 
340 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  47.92 
 
 
338 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  44.74 
 
 
328 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  40.48 
 
 
351 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  44.68 
 
 
338 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.82 
 
 
407 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  45.83 
 
 
338 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  42.31 
 
 
299 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  36.54 
 
 
398 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  40.82 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  38 
 
 
338 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>