109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2000 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  321  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  88.06 
 
 
172 aa  111  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  63.27 
 
 
173 aa  110  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  94.74 
 
 
385 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  84.62 
 
 
277 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  88.89 
 
 
2200 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  73.42 
 
 
522 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  96.36 
 
 
514 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  85.07 
 
 
514 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  91.67 
 
 
172 aa  107  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  94.74 
 
 
121 aa  104  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  84.85 
 
 
394 aa  104  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  91.38 
 
 
336 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  92.98 
 
 
104 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  91.53 
 
 
3275 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  85.48 
 
 
304 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  85.25 
 
 
105 aa  98.2  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  90.91 
 
 
305 aa  97.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  94.44 
 
 
100 aa  97.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  94.44 
 
 
112 aa  97.4  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  76.92 
 
 
582 aa  96.7  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  82.46 
 
 
143 aa  90.5  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  87.04 
 
 
192 aa  87.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  91.18 
 
 
563 aa  67  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3061  hypothetical protein  91.43 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.341918  normal  0.0301074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  90.91 
 
 
125 aa  61.6  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2997  hypothetical protein  93.75 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0932717  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  93.75 
 
 
209 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2342  hypothetical protein  93.75 
 
 
99 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1094  hypothetical protein  66 
 
 
97 aa  58.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0968333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  70.83 
 
 
98 aa  57.4  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  73.17 
 
 
132 aa  57.4  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2056  hypothetical protein  68.18 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  76.92 
 
 
149 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  75 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0363  hypothetical protein  93.33 
 
 
97 aa  55.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1997  hypothetical protein  76.92 
 
 
79 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.570421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3787  hypothetical protein  76.92 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  50 
 
 
561 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  44.83 
 
 
551 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1020  hypothetical protein  76.92 
 
 
88 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  42.03 
 
 
583 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  38.4 
 
 
940 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1701  hypothetical protein  69.23 
 
 
102 aa  51.2  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  45.68 
 
 
109 aa  50.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4768  hypothetical protein  75 
 
 
105 aa  50.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  41.33 
 
 
572 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4212  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40 
 
 
477 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0207401  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  45.61 
 
 
538 aa  48.5  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  51.85 
 
 
582 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  40 
 
 
558 aa  47.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  43.86 
 
 
565 aa  47.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  43.86 
 
 
565 aa  47.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1161  hypothetical protein  73.68 
 
 
95 aa  47.4  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  84.62 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  84 
 
 
577 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.61 
 
 
559 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  47.37 
 
 
564 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4508  hypothetical protein  81.48 
 
 
95 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.619373  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  45.61 
 
 
557 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  43.86 
 
 
553 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  54.1 
 
 
256 aa  45.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  44.58 
 
 
297 aa  44.3  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  54.17 
 
 
567 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  48.15 
 
 
559 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  54.17 
 
 
567 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  54.17 
 
 
567 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  54.1 
 
 
311 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  50 
 
 
566 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  54.17 
 
 
567 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  54.17 
 
 
567 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  52.08 
 
 
574 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  43.86 
 
 
567 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  47.06 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
312 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  55.36 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  52.08 
 
 
572 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  50 
 
 
373 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  45.12 
 
 
358 aa  42.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  45.61 
 
 
548 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  38.81 
 
 
559 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2430  hypothetical protein  49.15 
 
 
93 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  53.33 
 
 
814 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  45.68 
 
 
93 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  54.39 
 
 
387 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  54.39 
 
 
1083 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  44.44 
 
 
568 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  37.86 
 
 
172 aa  41.2  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  54.39 
 
 
281 aa  41.2  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  50.82 
 
 
101 aa  41.2  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  44.23 
 
 
559 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  54.17 
 
 
567 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  50.72 
 
 
137 aa  41.2  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  50 
 
 
383 aa  40.8  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  55.36 
 
 
178 aa  40.8  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  54.17 
 
 
567 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  52.63 
 
 
766 aa  40.8  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  52.08 
 
 
567 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  39.44 
 
 
570 aa  40.8  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  42.59 
 
 
567 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>