225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1883 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  734    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  48.65 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  42.18 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 		 381 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.66 
 
 		 362 aa  245  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.4 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 		 380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  37.25 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  34.45 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  40.27 
 
 		 369 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  40.27 
 
 		 369 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  35.01 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  35.01 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  35.03 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  35.01 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  35.01 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  40 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  40.27 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  35.01 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  40.13 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  35.01 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  34.73 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  37.02 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  35.2 
 
 		 364 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  35.2 
 
 		 364 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  34.92 
 
 		 360 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  35.29 
 
 		 367 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  35.01 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  35.01 
 
 		 367 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  35.01 
 
 		 367 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 		 374 aa  209  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  33.88 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.52 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  38.55 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  30.97 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.39 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  35.15 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.36 
 
 		 383 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  34.75 
 
 		 383 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  35.82 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  35.88 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  35.88 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  35.88 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  35.59 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  35.59 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  34.17 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.88 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.13 
 
 		 377 aa  135  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  29.43 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.35 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  34.55 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.55 
 
 		 367 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.89 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.08 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1052  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 		 378 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.15 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  30.05 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  28.7 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.1 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  24.86 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  27.42 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  27.42 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  27.42 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  28.9 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  28.65 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  29.71 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  23.29 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.3 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  26.3 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  26.3 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  26.01 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  22.74 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  26.01 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  26.01 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  25.72 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  26.01 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  25.72 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  28.42 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  25 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  33.18 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>