More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1739 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1739  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1763  hypothetical protein  72.08 
 
 
197 aa  290  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1959  hypothetical protein  72.08 
 
 
197 aa  290  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4873  hypothetical protein  71.57 
 
 
197 aa  288  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3118  hypothetical protein  68.6 
 
 
207 aa  279  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0494504  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2362  hypothetical protein  73.03 
 
 
196 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2311  hypothetical protein  68.31 
 
 
200 aa  261  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1711  hypothetical protein  63.27 
 
 
203 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0902  hypothetical protein  55.17 
 
 
194 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  55.17 
 
 
194 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2111  hypothetical protein  54.19 
 
 
195 aa  197  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0937  hypothetical protein  57.32 
 
 
194 aa  195  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1915  hypothetical protein  53.45 
 
 
194 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2238  hypothetical protein  53.45 
 
 
194 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.240114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0545  hypothetical protein  55.11 
 
 
195 aa  184  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.635717  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  54.1 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3240  hypothetical protein  52.78 
 
 
194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2031  hypothetical protein  51.1 
 
 
194 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136898  normal  0.743906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5601  hypothetical protein  52.22 
 
 
193 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  55.75 
 
 
195 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  55.75 
 
 
195 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  52.87 
 
 
196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1319  hypothetical protein  51.67 
 
 
194 aa  178  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233666  normal  0.206179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1662  hypothetical protein  51.1 
 
 
193 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2274  hypothetical protein  51.1 
 
 
193 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.296622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2297  hypothetical protein  50.55 
 
 
193 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2312  hypothetical protein  50.56 
 
 
194 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2190  hypothetical protein  50.56 
 
 
194 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588595  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  174  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3199  hypothetical protein  52.46 
 
 
196 aa  174  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1004  hypothetical protein  49.45 
 
 
193 aa  174  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181265  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0098  hypothetical protein  50.57 
 
 
193 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3142  hypothetical protein  48.33 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2182  decarboxylase family protein  58.48 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  48.33 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  51.7 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0084  hypothetical protein  52.35 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2252  hypothetical protein  48.9 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  53.45 
 
 
195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  53.45 
 
 
195 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1858  decarboxylase family protein  48.9 
 
 
195 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0387  decarboxylase family protein  48.9 
 
 
195 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1409  hypothetical protein  48.9 
 
 
195 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1104  decarboxylase family protein  48.9 
 
 
195 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1036  hypothetical protein  48.9 
 
 
195 aa  170  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2404  hypothetical protein  45.7 
 
 
200 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000021397  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0762  decarboxylase family protein  48.9 
 
 
195 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1264  decarboxylase family protein  48.9 
 
 
195 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1271  decarboxylase family protein  48.89 
 
 
195 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3461  hypothetical protein  50.29 
 
 
192 aa  166  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2766  decarboxylase family protein  48.65 
 
 
196 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0702  hypothetical protein  48.59 
 
 
188 aa  165  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1876  hypothetical protein  51.96 
 
 
208 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0093  hypothetical protein  48.57 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17975  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2080  hypothetical protein  49.21 
 
 
193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.723086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  45.6 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1866  hypothetical protein  48.85 
 
 
193 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4168  hypothetical protein  47.57 
 
 
195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0881208  normal  0.0325962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1797  hypothetical protein  52.6 
 
 
193 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2804  hypothetical protein  51.76 
 
 
193 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136211  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06310  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  54.12 
 
 
189 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3133  hypothetical protein  44.15 
 
 
193 aa  160  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.831461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6657  hypothetical protein  43.5 
 
 
189 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3041  hypothetical protein  51.18 
 
 
180 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.489889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1149  hypothetical protein  48.24 
 
 
185 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1062  hypothetical protein  41.85 
 
 
198 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2073  hypothetical protein  49.43 
 
 
199 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0689  hypothetical protein  45 
 
 
204 aa  154  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1270  hypothetical protein  48.04 
 
 
192 aa  154  6e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01195  hypothetical protein  48.63 
 
 
197 aa  154  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4238  hypothetical protein  47.19 
 
 
188 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0727087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2192  hypothetical protein  46.29 
 
 
180 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.261149  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4008  hypothetical protein  47.19 
 
 
188 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4082  hypothetical protein  47.19 
 
 
188 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0271621  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1151  hypothetical protein  43.58 
 
 
182 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1612  hypothetical protein  46.99 
 
 
197 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1896  hypothetical protein  43.41 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.508634  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  47.7 
 
 
197 aa  151  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  46.55 
 
 
184 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1870  hypothetical protein  46.55 
 
 
184 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3369  hypothetical protein  46.45 
 
 
199 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.510631  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3503  hypothetical protein  47.49 
 
 
200 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2568  hypothetical protein  41.62 
 
 
190 aa  150  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119538  lysine decarboxylase-related protein  48.02 
 
 
194 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  48.84 
 
 
185 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2422  hypothetical protein  40.46 
 
 
190 aa  149  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  45.98 
 
 
184 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1025  hypothetical protein  48.72 
 
 
207 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149206  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09413  hypothetical protein  42.39 
 
 
196 aa  148  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2601  hypothetical protein  49.41 
 
 
193 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.507928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1475  hypothetical protein  49.36 
 
 
206 aa  148  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.814615  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1491  hypothetical protein  46.29 
 
 
200 aa  148  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4116  hypothetical protein  46.55 
 
 
198 aa  148  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1767  putative lysine carboxylase  45.83 
 
 
179 aa  147  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557273  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  50 
 
 
337 aa  147  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0357  hypothetical protein  48.54 
 
 
198 aa  147  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1177  hypothetical protein  48.08 
 
 
207 aa  147  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123468  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0720  hypothetical protein  49.69 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1815  hypothetical protein  48.68 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2093  hypothetical protein  47.46 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  0.813262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>