63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1667 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  339  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  57.14 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  57.89 
 
 		 171 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  56.49 
 
 		 160 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  60.29 
 
 		 163 aa  177  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  58.09 
 
 		 164 aa  174  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  52.6 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  56.82 
 
 		 181 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  47.47 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  52 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  47.15 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  44.72 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  41.72 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  44.72 
 
 		 164 aa  123  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  48.74 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  44.8 
 
 		 170 aa  121  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  43.9 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  42.75 
 
 		 272 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  44.54 
 
 		 171 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  38.31 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  41.18 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  44.8 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  44.8 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  36.71 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  40.32 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  36.31 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  38.24 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  41.82 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  38.66 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  40.34 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  37.27 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  39.84 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  35.33 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  39.84 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  37.5 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  34.57 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  35.46 
 
 		 177 aa  91.3  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  35.25 
 
 		 161 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  34.39 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  33.99 
 
 		 205 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  34.56 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  29.82 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  32.89 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.47 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  32.47 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  29.79 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  32.59 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  24.55 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  26.02 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  23.57 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  26.52 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  23.42 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  31.01 
 
 		 534 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  30.97 
 
 		 125 aa  48.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  27.13 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  27.88 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  30.1 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  30.36 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  25.47 
 
 		 157 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  28.18 
 
 		 147 aa  42  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  26.12 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  23.6 
 
 		 287 aa  40.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>