More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1647 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 432 aa  873    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  80.67 
 
 		 422 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  79.25 
 
 		 403 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  79.84 
 
 		 431 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1323  DNA-directed DNA polymerase  74.09 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1964  DNA-directed DNA polymerase  71.97 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.560205  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  70.36 
 
 		 437 aa  564  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  74.27 
 
 		 399 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2353  DNA-directed DNA polymerase  67.15 
 
 		 413 aa  551  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.48043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  56.59 
 
 		 436 aa  451  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1234  DNA-directed DNA polymerase  58.6 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  55.85 
 
 		 387 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3545  UMUC-like DNA-repair protein  57.22 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3123  DNA-directed DNA polymerase  56.22 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  55.94 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  54.18 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  56.33 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  55.56 
 
 		 381 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  54.92 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  36.05 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  32.71 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  33.68 
 
 		 367 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  34.99 
 
 		 421 aa  203  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  33.42 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  35.37 
 
 		 360 aa  202  8e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  35.01 
 
 		 430 aa  202  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  35.48 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  34.79 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  32.55 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  33.51 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  33.67 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  33.67 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 420 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  34.03 
 
 		 365 aa  199  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3476  DNA-directed DNA polymerase  35.37 
 
 		 370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0765318  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  33.25 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  32.9 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  33.68 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  35.56 
 
 		 481 aa  196  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  33.95 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  34.01 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  33.94 
 
 		 424 aa  193  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  34.48 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  32.43 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  34.53 
 
 		 408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  33.76 
 
 		 381 aa  190  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  33.86 
 
 		 384 aa  189  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  32.75 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  34.13 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  32.74 
 
 		 408 aa  186  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  33.77 
 
 		 378 aa  186  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  31.14 
 
 		 371 aa  186  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  34.3 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  33.59 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  34.2 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  34.85 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  34.58 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  30.95 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  33.87 
 
 		 364 aa  184  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  31.97 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  32.98 
 
 		 415 aa  183  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  32.18 
 
 		 355 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  34.14 
 
 		 418 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  32.45 
 
 		 355 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  32.81 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  31.73 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.88 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  32.99 
 
 		 357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  32.58 
 
 		 380 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  31.38 
 
 		 390 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  34.39 
 
 		 369 aa  180  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  30.79 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  35.46 
 
 		 409 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  33.78 
 
 		 386 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.97 
 
 		 409 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  34.49 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  34.03 
 
 		 406 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  32.64 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  32.98 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  31.76 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  32.52 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  32.38 
 
 		 834 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  31.81 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  31.96 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  34.36 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  32.98 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  33.6 
 
 		 408 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  32.72 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  32.98 
 
 		 435 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3703  DNA polymerase IV  32.98 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260929  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0483  DNA polymerase family protein  27.59 
 
 		 360 aa  176  8e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0359018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  32.36 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  31.2 
 
 		 390 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  31.32 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  33.51 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  32.98 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  32.46 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  35.31 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  30.63 
 
 		 436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  29.18 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>