More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1644 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  100 
 
 
589 aa  1177    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  58.36 
 
 
574 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  50 
 
 
570 aa  555  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  50.18 
 
 
571 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  48.8 
 
 
563 aa  513  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  49.21 
 
 
593 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  46.87 
 
 
576 aa  491  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  48.75 
 
 
593 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  44.91 
 
 
578 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  45.09 
 
 
578 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  44.55 
 
 
578 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  45.6 
 
 
595 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  44.15 
 
 
580 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.02 
 
 
591 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  43.51 
 
 
585 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  44.56 
 
 
602 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  43.54 
 
 
584 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  44.39 
 
 
602 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  45.47 
 
 
598 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  45.12 
 
 
588 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  44.21 
 
 
602 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1347  Type I secretion system ATPase, PrtD  43.43 
 
 
568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.753541  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  43.09 
 
 
603 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.26 
 
 
596 aa  443  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.46 
 
 
585 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 
599 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  45.08 
 
 
619 aa  435  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  44.36 
 
 
575 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  43.66 
 
 
572 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  43.84 
 
 
575 aa  428  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  42.06 
 
 
588 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  43.38 
 
 
573 aa  422  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  41.01 
 
 
643 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  47.17 
 
 
595 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  39.68 
 
 
587 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  40.97 
 
 
587 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  45.6 
 
 
575 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0582  type I secretion system ATPase  42.99 
 
 
581 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430347  normal  0.0200066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  40.04 
 
 
579 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  39.41 
 
 
579 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  39.93 
 
 
587 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.19 
 
 
570 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  46.8 
 
 
596 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  40.85 
 
 
588 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  40.81 
 
 
581 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  37.59 
 
 
583 aa  385  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  39.69 
 
 
587 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  39.05 
 
 
573 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  38.7 
 
 
573 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.07 
 
 
593 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  39.01 
 
 
588 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  39.97 
 
 
591 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  38.65 
 
 
561 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  39.1 
 
 
589 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1645  type I secretion system ATPase  39.64 
 
 
582 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  38.27 
 
 
582 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  38.53 
 
 
577 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  38.03 
 
 
591 aa  363  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  36.8 
 
 
576 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  37.99 
 
 
589 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.55 
 
 
592 aa  361  2e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001278  ABC-type protease/lipase transport system ATPase and permease component  37.76 
 
 
535 aa  360  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2479  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.05 
 
 
587 aa  360  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0339809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  39.57 
 
 
582 aa  359  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  39.37 
 
 
600 aa  359  7e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  39.57 
 
 
582 aa  359  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0740  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.16 
 
 
587 aa  357  5e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0285827  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  38.8 
 
 
582 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  38.06 
 
 
573 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  40.75 
 
 
614 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  36.41 
 
 
583 aa  353  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2036  type I secretion system ATPase  38.82 
 
 
580 aa  352  7e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0619827 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  35.4 
 
 
590 aa  350  4e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6292  type I secretion system ATPase  38.99 
 
 
574 aa  350  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2541  type I secretion system ATPase  39.58 
 
 
598 aa  349  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  38.1 
 
 
582 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  39.56 
 
 
603 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  39.71 
 
 
598 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  34.79 
 
 
560 aa  347  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0063  putative type I secretion system, ATP-binding protein  35.53 
 
 
566 aa  347  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.94 
 
 
667 aa  346  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.53 
 
 
574 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  33.74 
 
 
581 aa  344  2.9999999999999997e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  38.7 
 
 
598 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  37.64 
 
 
569 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  37.34 
 
 
582 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  35.13 
 
 
577 aa  339  7e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  36.69 
 
 
578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0618  type I secretion system ATPase  38.74 
 
 
580 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0792  type I secretion system ATPase  37.35 
 
 
592 aa  335  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1348  Type I secretion system ATPase, PrtD  36.85 
 
 
556 aa  334  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.716552  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0679  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.54 
 
 
572 aa  333  4e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  35.82 
 
 
578 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0276  type I secretion system ATPase  36.67 
 
 
571 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  35.82 
 
 
578 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3974  type I secretion system ATPase  37.41 
 
 
572 aa  323  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  34.74 
 
 
668 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1663  type I secretion system ATPase  36.73 
 
 
588 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0244  Type I secretion system ATPase, PrtD  35.3 
 
 
592 aa  319  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1980  type I secretion system ATPase  36.39 
 
 
588 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15427  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>