More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1580 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  100 
 
 
303 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  50.33 
 
 
316 aa  293  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  49.65 
 
 
282 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  44.69 
 
 
325 aa  271  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  42.14 
 
 
324 aa  258  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  43.45 
 
 
327 aa  258  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  41.67 
 
 
324 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  42.14 
 
 
324 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  42.72 
 
 
323 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  42.14 
 
 
324 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  42.81 
 
 
341 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  41.9 
 
 
323 aa  255  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  45.19 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  42.32 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  41.97 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  42.95 
 
 
379 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  42.62 
 
 
318 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  42.62 
 
 
318 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  42.95 
 
 
325 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  46.13 
 
 
310 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  46.51 
 
 
316 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  40.85 
 
 
318 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  41.75 
 
 
303 aa  243  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  45.49 
 
 
313 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  40.33 
 
 
318 aa  242  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  45.86 
 
 
318 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  45.52 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  45.61 
 
 
315 aa  232  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  43.71 
 
 
338 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  42.96 
 
 
301 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  42.66 
 
 
321 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  42.56 
 
 
317 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  40.75 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  44.79 
 
 
313 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  41.39 
 
 
316 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  43.58 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  43.99 
 
 
318 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  41.22 
 
 
321 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  43.06 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  42.91 
 
 
318 aa  212  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  38.44 
 
 
312 aa  209  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  42.47 
 
 
304 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  41.22 
 
 
319 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  41.89 
 
 
318 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  39.6 
 
 
336 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  39.6 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  39.6 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  33.54 
 
 
371 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  35.48 
 
 
346 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  36.27 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  33.65 
 
 
350 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
349 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  33.12 
 
 
349 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  33.01 
 
 
363 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.78 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  32.25 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  32.8 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  32.8 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  31.85 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  32.48 
 
 
349 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  32.12 
 
 
351 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  39.93 
 
 
301 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  31.53 
 
 
347 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  31.53 
 
 
347 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  35.22 
 
 
292 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  36.59 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  36.59 
 
 
292 aa  155  9e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  30.82 
 
 
349 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  34.02 
 
 
292 aa  145  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  34.84 
 
 
274 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  31.06 
 
 
271 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  34.46 
 
 
310 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  32.2 
 
 
286 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  33.56 
 
 
293 aa  142  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  33.99 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  33 
 
 
406 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  31.67 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  34.56 
 
 
290 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  32.42 
 
 
287 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.56 
 
 
280 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  31.49 
 
 
282 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  32.67 
 
 
285 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  34.23 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.23 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  29.87 
 
 
289 aa  136  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  32.04 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  31.49 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  31.63 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  32.89 
 
 
292 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  28.97 
 
 
284 aa  132  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  31 
 
 
292 aa  132  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  31.29 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  32.33 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  32.39 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.81 
 
 
289 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.81 
 
 
289 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.81 
 
 
289 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.81 
 
 
289 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  33.46 
 
 
308 aa  129  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>