80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1570 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1570  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  unclonable  0.0000135434 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0187  hypothetical protein  41.31 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4358  hypothetical protein  39.63 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0722174  normal  0.346082 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0677  hypothetical protein  49.64 
 
 		 153 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.17 
 
 		 682 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1573  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000229166  decreased coverage  0.000000804561 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.41 
 
 		 745 aa  62.4  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  27.69 
 
 		 888 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  24.34 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  25.31 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 		 363 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  23.37 
 
 		 451 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  24.15 
 
 		 367 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  23.04 
 
 		 879 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.72 
 
 		 762 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  25.91 
 
 		 851 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.55 
 
 		 749 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  22.58 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.68 
 
 		 794 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 479 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.2 
 
 		 815 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.03 
 
 		 746 aa  50.8  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  21.85 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0678  hypothetical protein  37.18 
 
 		 110 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.45859  normal  0.914458 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1716  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.55 
 
 		 846 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116279  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1480  metallo-beta-lactamase family protein  23.18 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000092664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1750  metallo-beta-lactamase family protein  22.73 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  23.77 
 
 		 406 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.56 
 
 		 778 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1174  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  26.96 
 
 		 761 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000121236  hitchhiker  0.000000673843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3966  metallo-beta-lactamase family protein  22.02 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4076  metallo-beta-lactamase family protein  22.02 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104735 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.26 
 
 		 761 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4275  metallo-beta-lactamase family protein  22.02 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1139  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  23.97 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0577692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2129  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.62 
 
 		 829 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326593  normal  0.0900672 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1232  beta-lactamase domain protein  21.9 
 
 		 453 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000615653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  23.01 
 
 		 738 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1798  ComEC/Rec2-related protein  24.1 
 
 		 937 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.37 
 
 		 789 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3797  metallo-beta-lactamase  21.56 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3812  metallo-beta-lactamase  21.56 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5417  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.56 
 
 		 830 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3885  beta-lactamase domain-containing protein  21.56 
 
 		 300 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.53 
 
 		 679 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  27.14 
 
 		 872 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5966  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.27 
 
 		 829 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814009  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2111  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.27 
 
 		 829 aa  45.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.261797  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  22.32 
 
 		 461 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4187  metallo-beta-lactamase family protein  21.4 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1073  metallo-beta-lactamase family protein  21.56 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.698038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.05 
 
 		 840 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1702  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.57 
 
 		 839 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0283023 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  22.32 
 
 		 461 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1588  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  23.4 
 
 		 760 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.22 
 
 		 785 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.69 
 
 		 734 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.03 
 
 		 773 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4165  metallo-beta-lactamase family protein  21.56 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141054  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.22 
 
 		 812 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.92 
 
 		 773 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4123  metallo-beta-lactamase family protein  21.1 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.4 
 
 		 840 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  22.32 
 
 		 461 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.03 
 
 		 773 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.47 
 
 		 773 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0493  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.91 
 
 		 775 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2755  beta-lactamase domain-containing protein  21.1 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  20 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2627  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.67 
 
 		 801 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.36 
 
 		 766 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.08 
 
 		 797 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.74 
 
 		 772 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  22.13 
 
 		 461 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2423  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.68 
 
 		 773 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395966 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.52 
 
 		 802 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20 
 
 		 772 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20 
 
 		 772 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  36.51 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>