100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1567 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  100 
 
 
356 aa  729  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  1.60594e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  59.46 
 
 
354 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  57.06 
 
 
341 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  58.26 
 
 
341 aa  399  1e-110  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  55.65 
 
 
344 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  54.46 
 
 
344 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  54.72 
 
 
345 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  54.72 
 
 
345 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  52.44 
 
 
334 aa  332  9e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  49.85 
 
 
336 aa  321  1e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  47.46 
 
 
342 aa  316  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  51.3 
 
 
340 aa  315  1e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  50.16 
 
 
331 aa  311  8e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  48.39 
 
 
353 aa  299  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  47.8 
 
 
342 aa  298  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  50.49 
 
 
338 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  48.66 
 
 
365 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  44.48 
 
 
344 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  44 
 
 
345 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  45.91 
 
 
352 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  46.56 
 
 
340 aa  285  6e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  42.94 
 
 
333 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  54.1 
 
 
256 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  42.31 
 
 
342 aa  275  9e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  46.43 
 
 
352 aa  273  4e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  45.78 
 
 
342 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  43.31 
 
 
343 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  39.94 
 
 
334 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  43.67 
 
 
343 aa  270  3e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  42.58 
 
 
333 aa  270  3e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  40.72 
 
 
336 aa  269  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  41.82 
 
 
358 aa  265  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  42.77 
 
 
359 aa  264  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  6.304e-11  unclonable  2.89019e-13 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  44.52 
 
 
355 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  44.24 
 
 
369 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  44.52 
 
 
355 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  43.31 
 
 
344 aa  263  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  41.9 
 
 
332 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  42.45 
 
 
339 aa  263  5e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  42.77 
 
 
353 aa  262  7e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  43.71 
 
 
350 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  41.86 
 
 
353 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  42.9 
 
 
351 aa  258  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  41.96 
 
 
342 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  44.44 
 
 
335 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  42.55 
 
 
352 aa  256  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  43.69 
 
 
356 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  3.28283e-10 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  41.85 
 
 
352 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  42.19 
 
 
366 aa  253  5e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  44.44 
 
 
342 aa  252  8e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  5.20981e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  46.04 
 
 
281 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  40 
 
 
337 aa  250  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  41.58 
 
 
334 aa  245  7e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  40.12 
 
 
335 aa  243  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  41.99 
 
 
350 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  39.81 
 
 
357 aa  235  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  41.08 
 
 
361 aa  235  8e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  33.74 
 
 
344 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  39.11 
 
 
242 aa  172  8e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  55 
 
 
192 aa  150  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  50.4 
 
 
197 aa  134  2e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  51.61 
 
 
210 aa  132  1e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  49.21 
 
 
324 aa  130  5e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  49.21 
 
 
324 aa  130  5e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  45.24 
 
 
319 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  52.07 
 
 
330 aa  129  8e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  45.26 
 
 
326 aa  128  2e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  49.59 
 
 
329 aa  128  2e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.33606e-05 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  45.26 
 
 
328 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  47.11 
 
 
328 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  52.38 
 
 
334 aa  120  4e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  44.53 
 
 
141 aa  115  1e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  33.53 
 
 
327 aa  114  2e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  46.28 
 
 
336 aa  111  2e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  38.98 
 
 
332 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  43.66 
 
 
333 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  44.83 
 
 
127 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  43.97 
 
 
126 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  41.13 
 
 
337 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  35.2 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  38.14 
 
 
330 aa  94  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  41.67 
 
 
144 aa  89.7  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  40.71 
 
 
154 aa  89.4  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  34.96 
 
 
198 aa  85.9  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  37.07 
 
 
135 aa  85.5  1e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  42.71 
 
 
164 aa  77.4  3e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  38.2 
 
 
121 aa  70.1  5e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  42.17 
 
 
90 aa  67  5e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  44.93 
 
 
81 aa  63.2  6e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.08458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  39.19 
 
 
108 aa  62.4  1e-08  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  48.15 
 
 
55 aa  55.8  1e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  35.24 
 
 
117 aa  53.1  8e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4013  hypothetical protein  50.91 
 
 
48 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03541  conserved hypothetical protein  49.09 
 
 
49 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3870  hypothetical protein  49.09 
 
 
49 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0047  conserved hypothetical protein  49.09 
 
 
48 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  40.74 
 
 
81 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  44.68 
 
 
105 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  39.29 
 
 
77 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  35.19 
 
 
88 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.454055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>