More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1562 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  634  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  unclonable  1.77519e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.25 
 
 
325 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.5 
 
 
336 aa  259  5e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.09 
 
 
322 aa  254  2e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.15 
 
 
327 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  41.1 
 
 
330 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.61 
 
 
337 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.91 
 
 
326 aa  249  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  44 
 
 
322 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.46 
 
 
339 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.59 
 
 
328 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.97 
 
 
323 aa  246  5e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.26 
 
 
328 aa  245  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.16 
 
 
325 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  41.32 
 
 
320 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.36 
 
 
326 aa  244  1e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0421  hypothetical protein  44.22 
 
 
337 aa  244  1e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.18 
 
 
334 aa  244  2e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.33 
 
 
330 aa  244  2e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.33 
 
 
330 aa  244  2e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  39.43 
 
 
327 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.1 
 
 
336 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.44 
 
 
322 aa  243  4e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.06 
 
 
324 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  41.32 
 
 
356 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  4.25301e-06  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.78 
 
 
336 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.48 
 
 
323 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.32 
 
 
322 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  4.67968e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.57 
 
 
334 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  39.43 
 
 
329 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.54 
 
 
334 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18374e-05 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.2 
 
 
314 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.71 
 
 
349 aa  239  3e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  43.67 
 
 
330 aa  240  3e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.8 
 
 
321 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  39.31 
 
 
324 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.59 
 
 
328 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  40.57 
 
 
321 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.98 
 
 
328 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  39.62 
 
 
322 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.47 
 
 
328 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  39.8 
 
 
328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  38.64 
 
 
325 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.03 
 
 
328 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.06 
 
 
328 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  41.58 
 
 
331 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.58 
 
 
339 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.67 
 
 
327 aa  236  5e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  38.94 
 
 
322 aa  236  5e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.67 
 
 
325 aa  236  5e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.56 
 
 
344 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.26 
 
 
327 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.53 
 
 
330 aa  233  2e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.28 
 
 
330 aa  234  2e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.47 
 
 
334 aa  234  2e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.67 
 
 
353 aa  234  2e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  40.2 
 
 
322 aa  234  2e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  41.39 
 
 
328 aa  233  2e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  38.33 
 
 
328 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  41.06 
 
 
353 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.31 
 
 
330 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.98 
 
 
355 aa  233  4e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  40.55 
 
 
326 aa  233  4e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.81 
 
 
360 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  40.76 
 
 
366 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.54 
 
 
318 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.59 
 
 
351 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  41.56 
 
 
327 aa  232  7e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  41.45 
 
 
325 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.45 
 
 
323 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.13 
 
 
325 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  41.72 
 
 
323 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  38.46 
 
 
326 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.8 
 
 
328 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.3 
 
 
304 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  39.61 
 
 
312 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 
322 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  40.55 
 
 
338 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.95 
 
 
325 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  40.13 
 
 
337 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  41.31 
 
 
335 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  38.44 
 
 
339 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.51 
 
 
320 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  40.13 
 
 
334 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  39.6 
 
 
322 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.78 
 
 
335 aa  228  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.33 
 
 
324 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.49 
 
 
331 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.97 
 
 
327 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.13 
 
 
323 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.39 
 
 
327 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  39.17 
 
 
330 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.38 
 
 
326 aa  226  5e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.74 
 
 
345 aa  225  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.93 
 
 
358 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.74 
 
 
345 aa  225  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  37.46 
 
 
339 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  37.81 
 
 
325 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  41.53 
 
 
322 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>