More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1475 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1475  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  601  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  36.64 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  30.07 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  35.2 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  35.2 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  35.2 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  37.33 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  30.17 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  35.88 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  32.2 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  33.67 
 
 		 299 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  36.45 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  34.78 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  31.63 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  30.07 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  34.55 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  38.82 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6168  PfkB domain protein  37.11 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  hitchhiker  0.00391077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  34.67 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  40.26 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  39.93 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  36.45 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  38.54 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  35.47 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  36.04 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  36.04 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  36.04 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  36.04 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  34.97 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  37.16 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  38.05 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  35.71 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  30.48 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  28.9 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  32.67 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  33.33 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  35.06 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  35.06 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  35.06 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  35.06 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  35.06 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  34.12 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  35.06 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  36.82 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  35.06 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  35.06 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  38.06 
 
 		 320 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  30.51 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  34.42 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  33.66 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  34.95 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  33.67 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  34.43 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  38.44 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  36.88 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  34.11 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  35.74 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  34.11 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  37.88 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  37.54 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  33.44 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  32.89 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  38.83 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  33.33 
 
 		 353 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  38.69 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  36.12 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  38.69 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  34.11 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  39.54 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  31.44 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  29.43 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  26.74 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  32.78 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  34.26 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  33.9 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  36.05 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  24.92 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  31.42 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  27.53 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  35.69 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  35.43 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  34.2 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  35.22 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  30.3 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  30.3 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  30.36 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  31.46 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  35.26 
 
 		 314 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  28.9 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  35.18 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  30.82 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  34.88 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  31.38 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  33.67 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  36.64 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  31.99 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  31.99 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  35.79 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  28.8 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>