More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1461 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  74.41 
 
 		 214 aa  310  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  74.41 
 
 		 214 aa  310  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  72.51 
 
 		 213 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  70.48 
 
 		 213 aa  301  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  66.98 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  63.33 
 
 		 215 aa  271  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  66.34 
 
 		 227 aa  266  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  62.68 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  58.5 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  57.69 
 
 		 233 aa  235  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  49.28 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  49.28 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  50.49 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  51.94 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  47.66 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  47.2 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  47.2 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  49.28 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  47.66 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  46.26 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  48.58 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  46.73 
 
 		 220 aa  177  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  46.26 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  46.26 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  45.79 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  45.79 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  45.79 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  45.79 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  47.12 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  45.5 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  45.02 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  41.04 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 		 218 aa  141  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  37.98 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  42.03 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.71 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 224 aa  124  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.15 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 220 aa  104  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  37.24 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.81 
 
 		 440 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  41.98 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.5 
 
 		 378 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 213 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  38.51 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.6 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.6 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  43.09 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  42.04 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  42.14 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.5 
 
 		 378 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  42.95 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 411 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  38.93 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.23 
 
 		 382 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  32.88 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30400  predicted protein  32.41 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.923581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 370 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  34.67 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  42.04 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  37.8 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>