More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1424 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  99.69 
 
 
323 aa  670  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  100 
 
 
323 aa  674  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  95.96 
 
 
323 aa  622  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  88.82 
 
 
323 aa  577  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  95.54 
 
 
238 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  61.3 
 
 
321 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  61.18 
 
 
321 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  61.18 
 
 
333 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  61.18 
 
 
463 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  56.79 
 
 
325 aa  355  4e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  56.79 
 
 
325 aa  355  4e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.45152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  57.23 
 
 
497 aa  355  6e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  57.23 
 
 
327 aa  355  8e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  53.64 
 
 
329 aa  355  8e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  57.1 
 
 
441 aa  354  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  57.1 
 
 
325 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  56.92 
 
 
333 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  57.1 
 
 
325 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  57.1 
 
 
329 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  56.79 
 
 
325 aa  351  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  56.79 
 
 
325 aa  351  9e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  85 
 
 
216 aa  336  4e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  85 
 
 
216 aa  336  4e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  59.81 
 
 
229 aa  252  5e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  38.12 
 
 
321 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  39.94 
 
 
323 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  44.62 
 
 
274 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  38.81 
 
 
330 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  38.81 
 
 
330 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  38.81 
 
 
330 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  38.81 
 
 
330 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 
316 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  38.51 
 
 
330 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 
316 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 
316 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 
316 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 
316 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 
316 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  38.03 
 
 
343 aa  190  3e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  38.03 
 
 
332 aa  190  3e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  38.51 
 
 
348 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  38.51 
 
 
355 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  36.51 
 
 
314 aa  185  9e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  2.79647e-10 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  38.48 
 
 
330 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  35.67 
 
 
320 aa  180  3e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  36.83 
 
 
463 aa  180  3e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  37.1 
 
 
321 aa  179  6e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  36.19 
 
 
314 aa  179  6e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  34.47 
 
 
320 aa  178  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  59.88 
 
 
179 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  36.86 
 
 
284 aa  174  2e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  35.62 
 
 
316 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  35.62 
 
 
316 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  35.62 
 
 
316 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  35.62 
 
 
316 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  35.62 
 
 
316 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  35.62 
 
 
316 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  35.62 
 
 
316 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  35.62 
 
 
327 aa  172  6e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  36.49 
 
 
329 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  35.29 
 
 
316 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  36.14 
 
 
329 aa  169  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  35.38 
 
 
319 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  35.38 
 
 
319 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  35.38 
 
 
319 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  35.38 
 
 
319 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.51 
 
 
265 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  38.43 
 
 
277 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  40.17 
 
 
303 aa  147  4e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00517  transposase  84 
 
 
115 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  36.52 
 
 
259 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  36 
 
 
329 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  36.16 
 
 
286 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  39.71 
 
 
221 aa  135  1e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0408  transposase  96.67 
 
 
100 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  34.63 
 
 
302 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  32.76 
 
 
288 aa  123  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  34.76 
 
 
289 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  34.76 
 
 
289 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  34.76 
 
 
289 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  37.44 
 
 
206 aa  121  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  34.05 
 
 
284 aa  120  4e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  34.63 
 
 
289 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2626  transcriptional regulator, putative  32.62 
 
 
336 aa  118  2e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  29.92 
 
 
293 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  43.75 
 
 
157 aa  115  1e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1426  transcriptional regulator, putative  33.77 
 
 
289 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2928  transcriptional regulator, putative  33.77 
 
 
289 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1454  transcriptional regulator, putative  33.77 
 
 
289 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1420  transcriptional regulator, putative  33.77 
 
 
289 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  30.29 
 
 
288 aa  112  7e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  32.03 
 
 
288 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  37.57 
 
 
178 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3105  hypothetical protein  32.79 
 
 
290 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  34.57 
 
 
280 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2834  hypothetical protein  77.61 
 
 
93 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  30.56 
 
 
316 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  30.56 
 
 
316 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  30.56 
 
 
316 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  30.56 
 
 
316 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>