80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1408 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 96 aa  184  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  96.88 
 
 		 96 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  85.42 
 
 		 96 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  71.88 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  65.62 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0012  DNA polymerase, beta-like region  89.77 
 
 		 88 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0162009  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  77.08 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  77.08 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2046  hypothetical protein  66.02 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408644  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  62.11 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  55.21 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  46.88 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  52.08 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  57.97 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  41.76 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  46.32 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  41.67 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  41.3 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  42.53 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.29 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  56.52 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  35.16 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  39.56 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  43.33 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  34.74 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  36.96 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  37.36 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  37.89 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  39.08 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  36.56 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  34.69 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  39.13 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26330  predicted nucleotidyltransferase  37.68 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.155672  normal  0.055633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  37.35 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  37.68 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1345  DNA polymerase, beta-like region  49.02 
 
 		 55 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  35.87 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  35.62 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  37.97 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  35.11 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19940  predicted nucleotidyltransferase  42.35 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0104125 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  29.67 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  29.79 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  36.05 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  37.35 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  29.67 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  36.25 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  34.18 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  26.92 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  38.27 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  32.47 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 254 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  31.65 
 
 		 96 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  31.65 
 
 		 96 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  32.26 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  37.68 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  31.46 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  35.63 
 
 		 112 aa  40  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>