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for query gene Veis_1389 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
206 aa  425  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  67 
 
 
203 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  68 
 
 
207 aa  278  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  69.61 
 
 
187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  61.19 
 
 
201 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  59.39 
 
 
209 aa  258  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  60.29 
 
 
204 aa  254  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  55.72 
 
 
210 aa  248  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  60.59 
 
 
209 aa  241  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  53.2 
 
 
198 aa  222  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  55.8 
 
 
196 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  53.33 
 
 
194 aa  197  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  52.81 
 
 
203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 
201 aa  194  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  51.41 
 
 
231 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  51.69 
 
 
203 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  52.94 
 
 
221 aa  188  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  49.71 
 
 
211 aa  187  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  49.45 
 
 
205 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  46.08 
 
 
205 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  46.57 
 
 
205 aa  184  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  52.27 
 
 
200 aa  184  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  50.28 
 
 
197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  48.4 
 
 
205 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  48.4 
 
 
205 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  48.4 
 
 
205 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  50 
 
 
181 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  48.4 
 
 
205 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  48.4 
 
 
205 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  50 
 
 
181 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  50 
 
 
181 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  49.71 
 
 
204 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  50.6 
 
 
197 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  48.57 
 
 
205 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  46.33 
 
 
264 aa  174  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  47.51 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  45.5 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  47.28 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  47.28 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  47.28 
 
 
205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  46.89 
 
 
192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  49.12 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  46.74 
 
 
205 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  43.82 
 
 
191 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  41.49 
 
 
197 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  41.9 
 
 
188 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  43.98 
 
 
201 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  37.23 
 
 
197 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  49.03 
 
 
223 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  49.03 
 
 
223 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  41.82 
 
 
200 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  49.03 
 
 
202 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  46.31 
 
 
201 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  41.82 
 
 
200 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  48.37 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  42.17 
 
 
201 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  39.66 
 
 
198 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  47.02 
 
 
199 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  46.36 
 
 
197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  52 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  52 
 
 
226 aa  138  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  40.65 
 
 
219 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  32.84 
 
 
202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  38.67 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  39.76 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  43.05 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  33.69 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  48.06 
 
 
197 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  50.4 
 
 
196 aa  131  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 
210 aa  131  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  42.07 
 
 
197 aa  131  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  42.38 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  48.82 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  39.2 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  43.05 
 
 
196 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  48.44 
 
 
204 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  40.67 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  39.02 
 
 
198 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 
193 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 
193 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  47.69 
 
 
197 aa  124  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  32.98 
 
 
219 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  41.06 
 
 
197 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  40.79 
 
 
221 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  44.68 
 
 
197 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  36.72 
 
 
275 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
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NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  40.28 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 
217 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
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NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 
206 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
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NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  35.58 
 
 
201 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  39.26 
 
 
215 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
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NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  48 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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