62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1330 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  286  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1302  BLUF  71.13 
 
 
140 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0880  BLUF domain-containing protein  68.04 
 
 
140 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0920849  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0870  sensors of blue-light using FAD  70.1 
 
 
140 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0809  BLUF domain protein  68.04 
 
 
140 aa  140  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31456  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3630  BLUF domain-containing protein  68.42 
 
 
140 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92115  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4118  BLUF domain protein  68.42 
 
 
140 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0913  BLUF domain-containing protein  68.04 
 
 
140 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1075  hypothetical protein  64.13 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1829  BLUF domain-containing protein  58.7 
 
 
141 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0371971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3670  BLUF  44.54 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3989  hypothetical protein  47.11 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.693018  normal  0.0712703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  74.42 
 
 
577 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1233  BLUF domain protein  30.34 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0171481  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4508  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.619373  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  65.79 
 
 
522 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  60 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  89.29 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1670  BLUF domain-containing protein  31.65 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  88.89 
 
 
336 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  96.15 
 
 
582 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  88.89 
 
 
172 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2997  hypothetical protein  80.65 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0932717  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2753  BLUF domain-containing protein  27.06 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0494  BLUF  35.82 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.0369715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  88.46 
 
 
3275 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0764  BLUF domain-containing protein  32.1 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  85.19 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  85.19 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  81.48 
 
 
385 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  95.65 
 
 
514 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1828  BLUF domain-containing protein  31.11 
 
 
296 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366569  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  76.67 
 
 
304 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  84.62 
 
 
2200 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3061  hypothetical protein  81.48 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.341918  normal  0.0301074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  79.31 
 
 
121 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  91.3 
 
 
514 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  95.65 
 
 
173 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  84.62 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0523  BLUF domain protein  32.84 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  84.62 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  80.77 
 
 
277 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1378  BLUF domain-containing protein  31.17 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0363  hypothetical protein  91.67 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0397  BLUF domain-containing protein  36.99 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.160765  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  80.77 
 
 
394 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2342  hypothetical protein  81.48 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3848  BLUF domain protein  40.3 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4411  BLUF domain-containing protein  30 
 
 
309 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.611644  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7029  BLUF domain protein  30.95 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4257  hypothetical protein  64.86 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.751318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3406  BLUF  41.86 
 
 
225 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0323377  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3094  BLUF domain-containing protein  33.33 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4031  BLUF domain-containing protein  27.78 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4105  BLUF domain-containing protein  24.69 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4401  BLUF domain protein  27.78 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1867  hypothetical protein  30.36 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000117301  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  74.07 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0216  BLUF domain-containing protein  38.89 
 
 
450 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4761  BLUF domain protein  29.82 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0517  BLUF  37.74 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870314  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  86.96 
 
 
305 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>