More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1313 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 
227 aa  452  1e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  61.54 
 
 
224 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  60.1 
 
 
224 aa  253  2e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  60.1 
 
 
224 aa  253  2e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 
236 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
216 aa  130  1e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 
236 aa  114  1e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
231 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 
232 aa  99  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 
219 aa  94.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
218 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  32.26 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 
224 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 
232 aa  91.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  38.22 
 
 
223 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
222 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
226 aa  84.3  1e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  30.77 
 
 
222 aa  84.7  1e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  32.89 
 
 
227 aa  84  2e-15  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 
221 aa  84  2e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 
233 aa  83.6  2e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 
233 aa  82  6e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  32.02 
 
 
221 aa  81.6  9e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
236 aa  80.1  2e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 
215 aa  79  5e-14  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  32.92 
 
 
222 aa  77  2e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 
245 aa  77  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
217 aa  75.5  6e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 
209 aa  74.3  1e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
229 aa  73.6  2e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 
219 aa  72.8  5e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  37.06 
 
 
245 aa  72.4  6e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
219 aa  71.2  1e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
235 aa  70.1  3e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 
225 aa  69.7  3e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  33.33 
 
 
207 aa  68.9  6e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 
227 aa  68.6  8e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  42.45 
 
 
269 aa  67.8  1e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  36.42 
 
 
233 aa  67.8  1e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  6.8764e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 
229 aa  67  2e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 
229 aa  67  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  37.21 
 
 
229 aa  67.4  2e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
224 aa  67  2e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
234 aa  67  2e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2117  transcription regulator protein  28.83 
 
 
250 aa  67  2e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.930818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 
239 aa  67  2e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 
262 aa  66.6  3e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
290 aa  66.6  3e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  35 
 
 
230 aa  66.6  3e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
227 aa  66.6  3e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
244 aa  66.2  3e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3443  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
235 aa  66.2  4e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 
223 aa  65.9  5e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
232 aa  65.9  6e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 
250 aa  65.5  6e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
244 aa  65.1  8e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1296  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
233 aa  65.1  8e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.032312  normal  0.299541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
244 aa  65.1  8e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 
212 aa  65.1  9e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
227 aa  64.7  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
231 aa  64.7  1e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3759  GntR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
229 aa  64.7  1e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 
252 aa  64.3  1e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
267 aa  64.3  1e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0727  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
232 aa  64.3  1e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.475012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  32.24 
 
 
235 aa  63.9  2e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  31.82 
 
 
235 aa  64.3  2e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 
235 aa  63.9  2e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 
227 aa  64.3  2e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 
231 aa  64.3  2e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.81506e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 
222 aa  63.5  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
213 aa  63.9  2e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 
252 aa  63.5  3e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 
238 aa  63.2  3e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  25.6 
 
 
221 aa  63.2  3e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.28211e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
202 aa  63.2  3e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
213 aa  63.2  3e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 
232 aa  63.5  3e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  30.85 
 
 
235 aa  62.8  4e-09  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
229 aa  62.8  4e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
219 aa  63.2  4e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
219 aa  63.2  4e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
234 aa  62.8  4e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
234 aa  62.8  4e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  33.87 
 
 
226 aa  62.4  5e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
254 aa  62.4  5e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
229 aa  62.8  5e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
232 aa  62.8  5e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4561  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
227 aa  62  7e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
220 aa  61.6  8e-09  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
234 aa  62  8e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
235 aa  62  8e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
224 aa  61.6  9e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.95575e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
224 aa  61.6  9e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  32.56 
 
 
227 aa  61.2  1e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
229 aa  61.2  1e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 
226 aa  60.8  1e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>