More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1303 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 544 aa  1130    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  59.8 
 
 		 531 aa  651    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  80.44 
 
 		 526 aa  880    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  80.44 
 
 		 526 aa  879    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  53.61 
 
 		 528 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  53.61 
 
 		 528 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  53.14 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  46.94 
 
 		 528 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  44.83 
 
 		 527 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  47.09 
 
 		 528 aa  472  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  45.95 
 
 		 526 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  45.13 
 
 		 526 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  43.09 
 
 		 531 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  42.75 
 
 		 532 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  42.37 
 
 		 538 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  43.32 
 
 		 527 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  42.61 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  42.77 
 
 		 532 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 		 556 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  40.4 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 		 527 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 		 526 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  40.4 
 
 		 523 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  42.31 
 
 		 524 aa  378  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 		 529 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  39.01 
 
 		 528 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  38.12 
 
 		 517 aa  355  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 		 530 aa  346  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  39.83 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 		 526 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  35.34 
 
 		 520 aa  312  9e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  35.1 
 
 		 516 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  34.26 
 
 		 514 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  35.37 
 
 		 595 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 		 517 aa  274  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 		 526 aa  273  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 		 528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  35.32 
 
 		 519 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 		 538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  35.28 
 
 		 517 aa  267  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.2 
 
 		 542 aa  263  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  34.21 
 
 		 530 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.95 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  33.74 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 531 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 535 aa  260  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  33.33 
 
 		 533 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  32.61 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  33.94 
 
 		 520 aa  256  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 		 533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.12 
 
 		 516 aa  253  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  34.21 
 
 		 532 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  34.21 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  34.12 
 
 		 514 aa  249  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  33.67 
 
 		 528 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 525 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  34.94 
 
 		 524 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  34.3 
 
 		 526 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 521 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  33.81 
 
 		 521 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  34.81 
 
 		 522 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 544 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  34.59 
 
 		 525 aa  230  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  32.62 
 
 		 512 aa  227  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 		 549 aa  220  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  31.2 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 534 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 527 aa  196  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.7 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 		 532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 531 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.74 
 
 		 521 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.68 
 
 		 521 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.68 
 
 		 521 aa  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.68 
 
 		 521 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 521 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  27.91 
 
 		 532 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  26.49 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  27.64 
 
 		 528 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.49 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  26.49 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 541 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 495 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.95 
 
 		 528 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 531 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 		 535 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.73 
 
 		 530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 		 535 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 535 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>