More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1278 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
167 aa  346  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  69.46 
 
 
203 aa  243  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  69.46 
 
 
167 aa  239  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  69.46 
 
 
167 aa  239  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  71.26 
 
 
168 aa  239  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  75.89 
 
 
171 aa  236  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  73.1 
 
 
165 aa  234  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  71.63 
 
 
174 aa  230  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  63.12 
 
 
166 aa  197  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  56.85 
 
 
166 aa  177  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  47.88 
 
 
179 aa  173  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  47.2 
 
 
174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  51.8 
 
 
186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  52.17 
 
 
185 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  47.56 
 
 
213 aa  164  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  52.82 
 
 
178 aa  164  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  52.21 
 
 
178 aa  163  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  52.11 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  52.11 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  52.11 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  52.11 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  52.11 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  52.9 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  52.11 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  52.11 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  52.17 
 
 
176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  52.52 
 
 
178 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  52.52 
 
 
179 aa  160  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  52.52 
 
 
178 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  52.52 
 
 
178 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  51.41 
 
 
194 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  51.8 
 
 
178 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  51.8 
 
 
178 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  51.85 
 
 
164 aa  157  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  51.82 
 
 
165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.26 
 
 
173 aa  144  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  45.11 
 
 
167 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.81 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  39.1 
 
 
167 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  41.01 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  35.25 
 
 
169 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.43 
 
 
189 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.43 
 
 
189 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  36.8 
 
 
172 aa  94.4  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  41.96 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
193 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  30.94 
 
 
183 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  32.35 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  32.35 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.26 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  31.62 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  33.8 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  33.09 
 
 
173 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  31.41 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  36.07 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  32.35 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  36.07 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  36.07 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  34.15 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  35.25 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  32.35 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  33.09 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.77 
 
 
422 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  30.17 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  33.09 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  30.17 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  29.66 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  29.66 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  29.66 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
191 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  29.88 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  29.66 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.97 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  29.66 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.08 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  29.66 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  31.39 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  29.66 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.75 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.15 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  29.66 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1155  redoxin  32.12 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  35.25 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  31.1 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.76 
 
 
288 aa  74.7  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.39 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.88 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  33.33 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2085  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.04 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.96 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  31.78 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  34.53 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  29.41 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.08 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.28 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  30.19 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.23 
 
 
446 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  33.58 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  27.27 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>