266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1236 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1236  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1846  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.74 
 
 
208 aa  167  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0747958  normal  0.1639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1788  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.05 
 
 
208 aa  148  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.57 
 
 
222 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.41 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152148 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7470  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  35.89 
 
 
210 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5675  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.06 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6039  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.06 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2250  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.82 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488549  normal  0.224551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  36.9 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0754  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.22 
 
 
207 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665769  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.75 
 
 
209 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5382  acyl carrier protein phosphodiesterase, putative  33.96 
 
 
209 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4826  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.53 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  33.02 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1442  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  33.02 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  33.02 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  33.02 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  33.02 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  33.02 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  33.02 
 
 
211 aa  84.7  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  33.02 
 
 
211 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  33.33 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  32.55 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.32 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.79 
 
 
213 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1271  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.52 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  30.85 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.04 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.04 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  28.04 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  28.04 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.04 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  28.04 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  28.04 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  31.6 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.47 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  30.54 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.5 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  26.98 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.11 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1070  hypothetical protein  28.7 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.7 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  28.81 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  27.94 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.945859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0642  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.37 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.87 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.84 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0871  acyl carrier protein phosphodiesterase 3; NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.7 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.05 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.84 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.44 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.05 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.65 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  27.87 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  28.73 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  27.69 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.65 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.21 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.65 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.09 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3438  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.61 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0908  hypothetical protein  26.98 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  29.83 
 
 
196 aa  72  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0966  hypothetical protein  26.98 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  26.02 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  28.95 
 
 
199 aa  72  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  26.02 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  26.02 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  27.72 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  30.14 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  28.74 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.25 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  28.74 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  27.23 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.73 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  26.73 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  26.73 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.042412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  29.44 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  27.78 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  28.16 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  26.73 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.41 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.14 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  26.73 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  26.73 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  26.4 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  28.18 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.32 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.94 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>