More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1144 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  100 
 
 
312 aa  630  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  79.21 
 
 
307 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  79.08 
 
 
327 aa  491  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  77.49 
 
 
314 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  76.77 
 
 
313 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  74.45 
 
 
323 aa  455  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  73.95 
 
 
315 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  58.94 
 
 
314 aa  358  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  58.25 
 
 
320 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  57.88 
 
 
320 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  57.67 
 
 
304 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  57.33 
 
 
304 aa  341  9e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  56.25 
 
 
303 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  57.05 
 
 
304 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  56.72 
 
 
373 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  56.72 
 
 
304 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  56.72 
 
 
304 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  58.67 
 
 
304 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  56.77 
 
 
304 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  56.77 
 
 
304 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  56.77 
 
 
304 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  56.49 
 
 
306 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  56.77 
 
 
351 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  56.77 
 
 
351 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  55.48 
 
 
320 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  56.77 
 
 
304 aa  331  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  56.38 
 
 
342 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  56.07 
 
 
326 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  56.07 
 
 
304 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  57.14 
 
 
301 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  55.41 
 
 
344 aa  328  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  55.02 
 
 
321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  56.45 
 
 
325 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  53.92 
 
 
345 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  53.44 
 
 
355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  52.96 
 
 
302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  53.72 
 
 
304 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  48.23 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  51.94 
 
 
308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  52.33 
 
 
304 aa  298  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  48.34 
 
 
309 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  50 
 
 
322 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  49.49 
 
 
310 aa  279  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  48.36 
 
 
309 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  48.36 
 
 
309 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  48.52 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  48.84 
 
 
311 aa  269  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  47.56 
 
 
310 aa  269  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  45.78 
 
 
303 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  46.43 
 
 
311 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  47.44 
 
 
311 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  47.51 
 
 
332 aa  262  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  46.1 
 
 
306 aa  262  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  46.44 
 
 
293 aa  259  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  45.31 
 
 
312 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.87 
 
 
317 aa  256  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  44.97 
 
 
328 aa  255  8e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  44.16 
 
 
339 aa  255  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  42.57 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  45.21 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  42.77 
 
 
340 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  47.73 
 
 
317 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  41.85 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  42.11 
 
 
310 aa  240  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  40.58 
 
 
323 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  41.21 
 
 
313 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  42.57 
 
 
305 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  39.29 
 
 
304 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  39.6 
 
 
300 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  41.84 
 
 
282 aa  206  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  39.1 
 
 
305 aa  205  8e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
305 aa  201  9e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  38.29 
 
 
335 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.36 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.81 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  38.36 
 
 
300 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.53 
 
 
324 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
301 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
294 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.15 
 
 
327 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.24 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  37.58 
 
 
310 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  37.74 
 
 
311 aa  189  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  37.25 
 
 
305 aa  189  7e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.63 
 
 
323 aa  188  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  37.26 
 
 
315 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  32.47 
 
 
312 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  36.02 
 
 
323 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.9 
 
 
316 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  39.46 
 
 
300 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.79 
 
 
279 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  32.18 
 
 
312 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  32.18 
 
 
312 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  32.14 
 
 
312 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.16 
 
 
310 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.59 
 
 
312 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  32.59 
 
 
312 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.13 
 
 
309 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>