207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1013 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 265 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  75.31 
 
 		 268 aa  354  6.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  77.02 
 
 		 261 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  77.02 
 
 		 261 aa  348  4e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  68.11 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  64 
 
 		 253 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  64.54 
 
 		 253 aa  316  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  63.14 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  64.17 
 
 		 249 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  57.08 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  42.69 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  40.7 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  46.4 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  43.14 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  41.63 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  42.02 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  40.08 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  38.17 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  38.11 
 
 		 249 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  35.66 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  37.34 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  36.48 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  35.32 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  36.48 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  36.48 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  36.48 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  36.48 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  36.48 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  35.32 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  35.32 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  34.89 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  34.89 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  34.89 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  34.89 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  33.6 
 
 		 243 aa  148  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  35.94 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  36.65 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  32.14 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  29.46 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  28.18 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  29.63 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  28.64 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  28.51 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  28.31 
 
 		 278 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  29.49 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 236 aa  86.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  30.05 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  28.11 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  26.1 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  22.3 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  25.24 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  28.82 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  35.29 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  26.94 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  27.05 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 487 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  26.99 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 377 aa  72.4  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  24.63 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  32.52 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  27.5 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  29.32 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  25.11 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  34.69 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  26.87 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  28.7 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  28.7 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  30.89 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  27.27 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  30.08 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  29.34 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  30.08 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  27.59 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  30.08 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  27.59 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  23.33 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  31.58 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>