More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0972 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0972  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  650  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  1.40362e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.6 
 
 
332 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.88 
 
 
328 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  39.12 
 
 
332 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.45 
 
 
344 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 
314 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.78 
 
 
349 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  39.75 
 
 
327 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.61 
 
 
328 aa  221  1e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.58 
 
 
332 aa  220  2e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.91 
 
 
335 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.1 
 
 
335 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.53 
 
 
331 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.49 
 
 
323 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  38.02 
 
 
335 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6250  hypothetical protein  39.53 
 
 
329 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.62 
 
 
336 aa  216  6e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.24 
 
 
325 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.98 
 
 
327 aa  214  2e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.88 
 
 
338 aa  213  3e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  37.78 
 
 
342 aa  213  4e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  36.14 
 
 
327 aa  213  5e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.84 
 
 
327 aa  212  6e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.01 
 
 
324 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.93 
 
 
339 aa  212  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  38.18 
 
 
325 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.22 
 
 
327 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.28 
 
 
324 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.04 
 
 
331 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  36.19 
 
 
315 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  37.14 
 
 
344 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  39.74 
 
 
323 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  38.94 
 
 
335 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.98 
 
 
326 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  35.8 
 
 
319 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.19 
 
 
331 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  38.17 
 
 
334 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.07 
 
 
327 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.19 
 
 
331 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  40.2 
 
 
322 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.79 
 
 
321 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 
328 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  36.84 
 
 
330 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.69 
 
 
333 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  36.05 
 
 
356 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  36.61 
 
 
330 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  37.83 
 
 
310 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  36.71 
 
 
320 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  1.0806e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.11 
 
 
325 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  35.2 
 
 
322 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.96 
 
 
326 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  40.94 
 
 
323 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  38.46 
 
 
320 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  38.66 
 
 
328 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.33 
 
 
328 aa  205  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 
326 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1758  hypothetical protein  37.22 
 
 
328 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  34.84 
 
 
328 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2351  hypothetical protein  36.27 
 
 
339 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  38.78 
 
 
324 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  36.95 
 
 
330 aa  205  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  36.95 
 
 
330 aa  205  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  37.79 
 
 
335 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.18 
 
 
339 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  39.14 
 
 
323 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  37.41 
 
 
335 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.14 
 
 
328 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  39.14 
 
 
323 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36 
 
 
328 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  35.67 
 
 
325 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.51 
 
 
322 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  36.33 
 
 
327 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  34.91 
 
 
320 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  37.79 
 
 
339 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  35.33 
 
 
336 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.82 
 
 
338 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.09 
 
 
331 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  36.94 
 
 
343 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37 
 
 
336 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  38.49 
 
 
341 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  36.83 
 
 
339 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.53 
 
 
333 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  34.35 
 
 
335 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  37.42 
 
 
331 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  36.3 
 
 
331 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  35.49 
 
 
323 aa  201  1e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.5 
 
 
334 aa  201  1e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3049  hypothetical protein  37.5 
 
 
330 aa  201  1e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  36.15 
 
 
330 aa  201  1e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  36.33 
 
 
355 aa  201  2e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  38.01 
 
 
330 aa  201  2e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  36.18 
 
 
337 aa  200  2e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  33.55 
 
 
325 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  39.8 
 
 
361 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  36.51 
 
 
335 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.54 
 
 
325 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  37.74 
 
 
358 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  37.71 
 
 
334 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 
326 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  35.59 
 
 
324 aa  199  4e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>