More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0970 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
340 aa  703  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  2.73849e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  65.06 
 
 
341 aa  466  1e-130  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  64.52 
 
 
341 aa  459  1e-128  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  64.52 
 
 
341 aa  459  1e-128  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4694  extracellular solute-binding protein  68.45 
 
 
349 aa  446  1e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  66.13 
 
 
340 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  64.97 
 
 
351 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  64.33 
 
 
351 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  61.61 
 
 
341 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  64.38 
 
 
341 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  64.33 
 
 
351 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  1.24491e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  60 
 
 
347 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  64.98 
 
 
341 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  64.35 
 
 
341 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  64.04 
 
 
341 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  57.78 
 
 
340 aa  406  1e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  55.95 
 
 
345 aa  357  2e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  54.05 
 
 
336 aa  355  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.23 
 
 
339 aa  355  7e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.75 
 
 
336 aa  355  8e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  50.3 
 
 
351 aa  334  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  51.4 
 
 
335 aa  328  6e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  45.17 
 
 
342 aa  310  3e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  48.58 
 
 
358 aa  304  1e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  48.26 
 
 
358 aa  303  3e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  48.26 
 
 
358 aa  303  3e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  48.26 
 
 
358 aa  303  3e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  48.26 
 
 
358 aa  303  3e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  48.26 
 
 
358 aa  303  3e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  48.26 
 
 
358 aa  303  4e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  48.26 
 
 
346 aa  303  4e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  48.26 
 
 
358 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  47.63 
 
 
358 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  47.32 
 
 
356 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  40.72 
 
 
339 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  40.42 
 
 
339 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 
343 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  36.04 
 
 
343 aa  167  3e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  32.05 
 
 
344 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 
344 aa  160  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  35.52 
 
 
343 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  33.22 
 
 
344 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 
350 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  33.24 
 
 
343 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 
343 aa  152  6e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  32.37 
 
 
346 aa  149  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.23 
 
 
347 aa  149  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.06 
 
 
341 aa  147  2e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.06 
 
 
341 aa  147  2e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 
342 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  31.5 
 
 
342 aa  143  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 
337 aa  140  4e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  33.44 
 
 
326 aa  140  4e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 
343 aa  139  5e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  34.11 
 
 
364 aa  140  5e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  3.39151e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 
343 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2736  extracellular solute-binding protein family 1  31.95 
 
 
325 aa  135  1e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288744  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  32.99 
 
 
344 aa  134  2e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  31.88 
 
 
340 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  33.07 
 
 
340 aa  133  4e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
322 aa  133  4e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.25 
 
 
338 aa  131  2e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  5.51212e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
335 aa  130  4e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2481  extracellular solute-binding protein family 1  31.72 
 
 
330 aa  128  1e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.37214  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 
340 aa  128  1e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 
342 aa  128  1e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
342 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 
350 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 
342 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 
378 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 
341 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 
347 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  30.37 
 
 
266 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  30.26 
 
 
379 aa  119  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
326 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  28.81 
 
 
367 aa  117  2e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2031  ABC-type transporter, periplasmic component  25.79 
 
 
331 aa  113  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.702659  hitchhiker  0.000664756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.98 
 
 
341 aa  110  4e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
338 aa  109  7e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2025  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 
296 aa  109  7e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.727103  hitchhiker  2.6678e-09 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.69 
 
 
341 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
341 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.1 
 
 
341 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.1 
 
 
341 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  25.98 
 
 
341 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 
333 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  24.5 
 
 
339 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3891  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
327 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
325 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  27.27 
 
 
344 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  26.95 
 
 
344 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
340 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.84 
 
 
339 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  26.32 
 
 
344 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1078  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
322 aa  99.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  26.62 
 
 
344 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3474  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.64 
 
 
301 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  26.62 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  26.62 
 
 
344 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  26.62 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>