More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0945 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
309 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.95 
 
 
309 aa  362  6e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
296 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 
300 aa  295  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
300 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0038089  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.4 
 
 
328 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
307 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 
307 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
294 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180469  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.18 
 
 
354 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
308 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.732084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
330 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  34.98 
 
 
318 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
291 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
312 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.142654 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
294 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493427  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
313 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.65 
 
 
319 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
289 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
319 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  hitchhiker  0.000205378 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
314 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23420  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.18 
 
 
310 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
299 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
313 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
299 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
293 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2103  ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 
296 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.512676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
312 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
294 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
309 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5738  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.98 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01540  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.89 
 
 
329 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1183  ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2817  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1304  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  31.35 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00913134  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  37.93 
 
 
305 aa  178  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.73 
 
 
310 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
302 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0540669  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000672298  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
317 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
332 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
325 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
298 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
299 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
304 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.026642  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
313 aa  168  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
305 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.41 
 
 
300 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
320 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305055  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
305 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3986  putative ABC transporter (permease protein)  36.51 
 
 
313 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
305 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6025  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
305 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.825826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
308 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
308 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
305 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
312 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.746865  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23840  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.08 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.65 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0068  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.13 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
308 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
328 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
290 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
306 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
305 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
296 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283647  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
312 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
311 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0016702  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
320 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
296 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
312 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
304 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0278828  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
316 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1315  ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 
301 aa  158  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7706  sugar ABC transporter permease protein  33.56 
 
 
303 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
319 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0200859  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1618  binding-protein-dependent transport protein  33.92 
 
 
296 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
340 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.162139 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
295 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
288 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
308 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  35.07 
 
 
311 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.53 
 
 
312 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.44322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
306 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
275 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2905  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
315 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.12 
 
 
318 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
315 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
318 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
297 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
299 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>