More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0926 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0926  glutathione synthetase  100 
 
 
318 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  80.63 
 
 
316 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3907  glutathione synthetase  80.63 
 
 
316 aa  527  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0225291  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  81.53 
 
 
317 aa  528  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4539  glutathione synthetase  79.35 
 
 
316 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  78.1 
 
 
315 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  76.19 
 
 
316 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4540  glutathione synthetase  76.8 
 
 
318 aa  494  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  76.58 
 
 
316 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  74.6 
 
 
315 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0432  glutathione synthetase  70.51 
 
 
317 aa  457  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  66.77 
 
 
318 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  65.72 
 
 
318 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  65.72 
 
 
318 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  65.72 
 
 
318 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0259  glutathione synthetase  66.04 
 
 
318 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  65.72 
 
 
318 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  65.72 
 
 
318 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  65.72 
 
 
318 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  65.72 
 
 
318 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2874  glutathione synthetase  66.46 
 
 
318 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.235828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  65.41 
 
 
318 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0528  glutathione synthetase  64.98 
 
 
318 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2780  glutathione synthetase  64.26 
 
 
318 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417394  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  65.83 
 
 
318 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2249  glutathione synthetase  65.83 
 
 
318 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2918  glutathione synthetase  64.26 
 
 
318 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2863  glutathione synthetase  65.83 
 
 
318 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4187  glutathione synthetase  64.04 
 
 
318 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  64.01 
 
 
317 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0294  glutathione synthetase  60 
 
 
317 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  60.38 
 
 
323 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  60.06 
 
 
324 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1954  glutathione synthetase  58.92 
 
 
313 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.280823  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  60.06 
 
 
323 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0574  glutathione synthetase  56.73 
 
 
318 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.918969  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2409  glutathione synthase  55.13 
 
 
314 aa  334  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0010  glutathione synthetase  52.68 
 
 
339 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163572  normal  0.0543888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  52.73 
 
 
315 aa  331  8e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  53.04 
 
 
316 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  50 
 
 
320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  50.32 
 
 
318 aa  322  6e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  50.8 
 
 
316 aa  322  7e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  48.9 
 
 
319 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  49.2 
 
 
316 aa  318  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  50.96 
 
 
316 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  49.21 
 
 
318 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  49.69 
 
 
319 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  49.52 
 
 
317 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  49.68 
 
 
318 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  48.56 
 
 
316 aa  316  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  48.25 
 
 
316 aa  315  7e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  48.42 
 
 
317 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  49.84 
 
 
317 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  48.87 
 
 
316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  49.52 
 
 
315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  47.95 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  50.48 
 
 
319 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  49.03 
 
 
315 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  50.48 
 
 
319 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  48.88 
 
 
317 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  48.74 
 
 
328 aa  312  4.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  48.56 
 
 
317 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  48.56 
 
 
317 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  48.73 
 
 
315 aa  311  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  48.41 
 
 
315 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  50.16 
 
 
319 aa  310  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  48.74 
 
 
319 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  48.73 
 
 
315 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  48.73 
 
 
315 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  48.73 
 
 
315 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  48.73 
 
 
315 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  48.41 
 
 
315 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  48.41 
 
 
315 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  48.71 
 
 
317 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  47.95 
 
 
317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  48.42 
 
 
317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  48.06 
 
 
315 aa  309  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  48.42 
 
 
317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  49.19 
 
 
318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  49.35 
 
 
317 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  47.91 
 
 
316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  47.91 
 
 
316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  47.74 
 
 
315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  47.91 
 
 
316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  47.91 
 
 
315 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  47.91 
 
 
316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  47.91 
 
 
316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  47.91 
 
 
316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  47.91 
 
 
316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  50.32 
 
 
317 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  47.91 
 
 
316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  48.09 
 
 
322 aa  305  6e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  48.2 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  47.48 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  48.71 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  50 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  48.22 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  46.86 
 
 
319 aa  301  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  48.39 
 
 
317 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>