More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0909 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  53.53 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  51.19 
 
 
339 aa  311  6.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50 
 
 
330 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50.69 
 
 
330 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  52.56 
 
 
328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  47.26 
 
 
331 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  48.16 
 
 
336 aa  292  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  50 
 
 
345 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  50 
 
 
345 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  46.03 
 
 
328 aa  288  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  48.93 
 
 
335 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  50.32 
 
 
335 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  48.01 
 
 
344 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.99 
 
 
325 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  49.5 
 
 
360 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.23 
 
 
328 aa  285  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.23 
 
 
328 aa  285  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  48 
 
 
339 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.08 
 
 
327 aa  285  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.08 
 
 
325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  48.99 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  45.89 
 
 
321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  43.29 
 
 
356 aa  281  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  44.52 
 
 
335 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.55 
 
 
304 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  47.96 
 
 
337 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.99 
 
 
327 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.49 
 
 
331 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  47.6 
 
 
314 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  49.54 
 
 
334 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.66 
 
 
333 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  47.44 
 
 
324 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.55 
 
 
349 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  43.03 
 
 
351 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.39 
 
 
325 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.01 
 
 
328 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  47.44 
 
 
328 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  46.06 
 
 
323 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.92 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  44.06 
 
 
322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  46.82 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  47.95 
 
 
322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.42 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  45.31 
 
 
318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  42.72 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.19 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  45.24 
 
 
324 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.42 
 
 
327 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.49 
 
 
323 aa  272  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  41.77 
 
 
328 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.98 
 
 
336 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.81 
 
 
335 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.86 
 
 
330 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.91 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0797  hypothetical protein  46.28 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  45.39 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  48.46 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.05 
 
 
330 aa  270  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.05 
 
 
330 aa  270  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.42 
 
 
328 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.58 
 
 
339 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.32 
 
 
334 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  44.03 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  42.28 
 
 
383 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.15 
 
 
330 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  44.44 
 
 
334 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.48 
 
 
336 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.11 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  43 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  45.43 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.77 
 
 
328 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  44.29 
 
 
330 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.65 
 
 
334 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.08 
 
 
332 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.96 
 
 
339 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  39.02 
 
 
343 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  45.4 
 
 
321 aa  265  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  43.69 
 
 
334 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  43.34 
 
 
330 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.03 
 
 
333 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  46.37 
 
 
325 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  46.37 
 
 
325 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  42.81 
 
 
322 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  43.88 
 
 
324 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.85 
 
 
335 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.51 
 
 
335 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.05 
 
 
327 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  41.67 
 
 
341 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  41.67 
 
 
344 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  41.27 
 
 
327 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  44.65 
 
 
326 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  43.49 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  43.89 
 
 
327 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  43.41 
 
 
326 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  46.42 
 
 
330 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  42.95 
 
 
332 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.86 
 
 
328 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.69 
 
 
355 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  45.31 
 
 
322 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>