More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0879 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
271 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000193962  normal  0.966578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1887  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.99 
 
 
248 aa  231  8e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1711  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.32 
 
 
242 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3678  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.67 
 
 
240 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.49092  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10923  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
243 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269045  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.21 
 
 
659 aa  95.9  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1755  enoyl-CoA hydratase  34.05 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4518  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4812  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4431  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4992  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388804  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0067  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.93 
 
 
249 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.253569  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.73 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1279  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.74 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.82 
 
 
661 aa  84.7  1e-15  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
261 aa  84.7  1e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.95 
 
 
253 aa  84  2e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 
266 aa  84  2e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.45 
 
 
269 aa  83.6  3e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 
273 aa  83.2  4e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.67 
 
 
259 aa  83.2  4e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
268 aa  83.2  4e-15  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  26.97 
 
 
662 aa  82.8  5e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
260 aa  82.8  6e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.68 
 
 
269 aa  82.4  7e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  31.77 
 
 
262 aa  82.4  8e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.03 
 
 
262 aa  82  1e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.09 
 
 
249 aa  81.3  1e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
262 aa  82  1e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
206 aa  80.9  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  26.26 
 
 
662 aa  81.3  2e-14  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3153  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.74 
 
 
279 aa  80.5  3e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
261 aa  80.5  3e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
269 aa  80.1  3e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
262 aa  80.5  3e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4100  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.88 
 
 
252 aa  80.1  4e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050755  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
204 aa  79.7  4e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2998  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
206 aa  80.1  4e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.172994  normal  0.145485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.79 
 
 
260 aa  80.1  4e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
254 aa  80.1  4e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  34.86 
 
 
267 aa  79.7  5e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0913  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
206 aa  79.7  5e-14  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
262 aa  79.7  5e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
262 aa  79.7  5e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
260 aa  79.7  5e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.26 
 
 
263 aa  79.3  6e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  36.16 
 
 
261 aa  79  8e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.69 
 
 
257 aa  79  8e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.79 
 
 
273 aa  79  9e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.87 
 
 
256 aa  78.2  1e-13  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.16 
 
 
257 aa  78.6  1e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.36 
 
 
260 aa  78.6  1e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
265 aa  78.2  1e-13  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.65 
 
 
253 aa  77.4  2e-13  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  8.37602e-06 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  29.78 
 
 
263 aa  77.8  2e-13  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
261 aa  77.4  2e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 
258 aa  77.8  2e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.67 
 
 
264 aa  77.4  2e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29424  normal  0.413397 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2845  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.56 
 
 
254 aa  77.4  2e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 
258 aa  77  3e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
265 aa  77  3e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
261 aa  76.6  3e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  36.52 
 
 
257 aa  77  3e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0963  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.18 
 
 
256 aa  77  3e-13  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  25.57 
 
 
662 aa  77  3e-13  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1071  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.18 
 
 
256 aa  77  3e-13  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
265 aa  77  3e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  33 
 
 
262 aa  76.6  3e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 
254 aa  76.6  4e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
256 aa  76.6  4e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.28 
 
 
252 aa  76.6  4e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  31.77 
 
 
269 aa  76.6  4e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 
266 aa  76.3  5e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.17 
 
 
257 aa  76.3  5e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  30.35 
 
 
261 aa  76.3  5e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  26.19 
 
 
254 aa  76.3  5e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1868  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 
233 aa  75.9  6e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
266 aa  75.9  6e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  31.79 
 
 
265 aa  75.9  7e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  28.4 
 
 
257 aa  75.9  7e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  29.08 
 
 
273 aa  75.9  7e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
269 aa  75.9  7e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  31.96 
 
 
264 aa  75.9  7e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
250 aa  75.5  8e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.95 
 
 
663 aa  75.5  8e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0474  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.53 
 
 
236 aa  74.7  1e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.16 
 
 
263 aa  75.1  1e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 
272 aa  75.1  1e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  75.1  1e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
266 aa  74.7  1e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 
255 aa  75.5  1e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.89 
 
 
279 aa  75.1  1e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 
255 aa  75.5  1e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0740  enoyl-CoA hydratase  33.03 
 
 
261 aa  75.5  1e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
266 aa  74.7  1e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
267 aa  75.1  1e-12  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>